BrainSTEM 数据集

该数据集属于神经系统疾病领域,主题涵盖神经系统疾病,采用 NWB 标准组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关

dandi
2023-04-16 更新
浏览 12
其他神经系统疾病神经生理学NWB 标准BRAIN InitiativeDANDI Archive
BrainSTEM dataset

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2023-04-16
版本
draft

资源简介

BrainSTEM 数据集

BrainSTEM dataset 是一个公开的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 000479。该数据集属于神经系统疾病领域,主题涵盖神经系统疾病,采用 NWB 标准组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关。数据集的联系人为 Petersen, Peter C.。作为神经科学领域公开共享的资源,它面向神经系统疾病相关研究,为研究人员提供标准化的神经生理学数据访问入口。整体而言,该数据集以神经生理学记录为核心,依托 DANDI Archive 平台进行发布与共享,便于研究者按需检索、下载并用于后续分析。

【数据集背景】

该数据集来自 DANDI Archive,属于 BRAIN Initiative 相关的神经生理学数据资源,数据集编号为 dandiset 000479。其英文名称为 BrainSTEM dataset,联系人为 Petersen, Peter C.。数据集所属领域为神经系统疾病,主题涵盖神经系统疾病。DANDI Archive 是神经生理学数据共享平台,采用 NWB 标准对数据进行组织与发布,该数据集即遵循这一标准。关于该数据集的具体研究项目背景、资助信息、机构归属等更详细的背景资料,源站未提供。

【数据内容】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,属于神经系统疾病领域,主题涵盖神经系统疾病。其数据内容以神经生理学记录为核心,采用 NWB 标准进行组织。关于具体的记录模态、通道数量、采样率、受试对象种类与数量、实验任务设计、时间跨度、文件规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,即 DANDI Archive,数据集编号为 dandiset 000479,联系人为 Petersen, Peter C.,并与 BRAIN Initiative 相关。关于具体的采集设备、采集地点、实验方案、伦理审批信息以及数据提交时间等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集属于神经系统疾病领域的神经生理学数据,采用 NWB 标准,适用于神经生理学数据的检索、下载与再利用,可服务于神经系统疾病相关的研究分析。由于数据集主题涵盖神经系统疾病,其潜在用途包括围绕神经系统疾病的神经生理学特征开展探索性分析。关于该数据集具体支持的标准化分析流程、配套工具或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集发布在 DANDI Archive 上,可通过该平台进行访问。使用者可依据数据集编号 dandiset 000479 在 DANDI Archive 中检索并获取数据。数据采用 NWB 标准,通常可配合支持 NWB 格式的工具进行读取与处理。关于具体的下载方式、访问权限、是否需要申请、推荐工具链及版本要求等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 上发布的 NWB 标准神经生理学数据集,与 BRAIN Initiative 相关。关于数据质量评估指标、缺失情况、噪声水平、标注完整性、已知偏差或使用限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的联系人为 Petersen, Peter C.,来源站为 dandiarchive.org,数据集编号为 dandiset 000479。关于具体的引用格式、DOI、许可协议类型及使用条款等,源站未提供。

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下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000479

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000479. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Petersen, Peter C…

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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