BraiDyn-BC:小鼠提示拉杆任务数据集

主题标签:神经系统疾病、神经生理学、NWB标准、BRAIN Initiative、小鼠行为任务、拉杆任务。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2025-04-28 更新
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时间序列神经系统疾病神经生理学NWB标准BRAIN Initiative小鼠行为任务拉杆任务
BraiDyn-BC: mouse cued-lever-pull task dataset

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2025-04-28
版本
0.250705.0947

资源简介

BraiDyn-BC:小鼠提示拉杆任务数据集

BraiDyn-BC: mouse cued-lever-pull task dataset 是一个公开的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001425。该数据集采用 NWB 标准组织神经生理学数据,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源,联系人为 Nakae, Ken。从主题上看,该数据集聚焦于神经系统疾病领域,同时涉及神经生理学、小鼠行为任务与拉杆任务等方向。数据集名称中的“cued-lever-pull task”表明其围绕小鼠在提示线索下执行拉杆动作的行为范式展开,而“BraiDyn-BC”则作为该数据集的标识名称。整体而言,这是一个面向神经系统疾病研究、以小鼠行为任务为背景、遵循 NWB 标准并来源于 DANDI Archive 的公开神经生理学数据集。

【数据集背景】

该数据集属于神经系统疾病领域,本站分类将其归入“神经系统疾病 / 其他”。其来源站为 dandiarchive.org,源站描述指出这是 DANDI Archive 的 dandiset 001425,属于 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。数据集英文名称为 BraiDyn-BC: mouse cued-lever-pull task dataset,联系人为 Nakae, Ken。从主题标签来看,该数据集涵盖神经系统疾病、神经生理学、NWB 标准、BRAIN Initiative、小鼠行为任务以及拉杆任务等关键词。这些信息共同勾勒出该数据集的基本定位:它是一个在神经系统疾病研究背景下,围绕小鼠行为任务采集并公开的神经生理学数据资源。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括神经系统疾病、神经生理学、NWB 标准、BRAIN Initiative、小鼠行为任务、拉杆任务。数据集名称明确指向“mouse cued-lever-pull task”,即小鼠在提示线索下执行拉杆任务的行为范式。数据以 NWB 标准进行组织,属于神经生理学数据集。关于具体的神经元记录类型、脑区、动物数量、试验次数、行为指标、神经生理信号种类等详细内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001425。源站描述其为 NWB-standard neurophysiology dataset,并标注为 BRAIN Initiative 相关数据。联系人为 Nakae, Ken。关于具体的采集设备、采集参数、实验地点、实验时间、动物品系、手术方法、行为训练流程等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于神经系统疾病领域的研究,尤其是与神经生理学、NWB 标准数据使用、BRAIN Initiative 相关数据实践,以及小鼠行为任务和拉杆任务相关的研究场景。由于数据集涉及小鼠在提示线索下执行拉杆任务,可能适合用于分析行为任务相关的神经生理数据。但关于具体的适用分析方向、可支持的疾病模型、可验证的科学假设等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 DANDI Archive 上的公开数据集,编号为 dandiset 001425,采用 NWB 标准。使用者可依据 DANDI Archive 的常规访问方式获取该数据集,并利用支持 NWB 标准的工具进行读取与处理。关于具体的数据下载步骤、文件结构、依赖软件、读取示例、预处理流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集遵循 NWB 标准,来源于 DANDI Archive,并与 BRAIN Initiative 相关,这些信息表明其在数据组织规范方面具有明确标准。联系人为 Nakae, Ken,可作为数据相关问题的联系人。然而,关于数据质量评估、缺失情况、噪声水平、标注完整性、样本量、潜在偏差、使用限制或伦理约束等具体内容,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001425。关于具体的引用格式、作者列表、版本号、DOI、许可协议类型、使用条款或再分发要求等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001425

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001425. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Nakae, Ken.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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