测序数据3(CNV-seq)

本研究旨在利用高分辨率CNV-seq技术探究脑发育异常儿童的拷贝数变异(CNVs)。目标是提高诊断率并拓展对与脑发育异常相关的基因组结构的认识

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基因组分类神经系统疾病CNV-seq拷贝数变异脑发育异常临床遗传学儿童神经病学罕见遗传病
<b>Sequencing data3 (CNV-seq)</b>

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

测序数据3(CNV-seq)

Sequencing data3 (CNV-seq) 是一套面向脑发育异常儿童拷贝数变异研究的测序数据集,源站标题与数据集英文名一致,归类于神经系统疾病 / 其他方向,来源站为 doi.org,作者为 Zhu, Shaohua,由 figshare 机构发布,发布时间为 2025 年。该数据集依托高分辨率 CNV-seq 技术,围绕脑发育异常儿童的基因组拷贝数变异展开,旨在提高此类疾病的诊断率,并拓展对相关基因组结构的认识。数据集为临床遗传学、儿童神经病学以及罕见遗传病的转化研究提供信息支撑,源站特别说明该样本仅用于特殊患者。整体而言,该数据集属于医学分子检测与神经系统疾病交叉领域的研究数据资源,采用开放许可方式发布,便于相关研究人员获取与使用。

【数据集背景】

该数据集的研究背景聚焦于脑发育异常儿童的遗传学病因探查。源站描述指出,本研究旨在利用高分辨率 CNV-seq 技术探究脑发育异常儿童的拷贝数变异(CNVs),其目标是提高诊断率,并拓展对与脑发育异常相关的基因组结构的认识。数据集被定位为对临床遗传学、儿童神经病学以及罕见遗传病转化研究具有价值的信息资源。源站同时给出特别说明:该样本仅用于特殊患者。数据集的主题标签为“Medical molecular engineering of nucleic acids and proteins”,反映出其在核酸与蛋白质分子工程方向上的学科归属。

【数据内容】

该数据集的核心内容为基于 CNV-seq 技术产生的测序数据,用于检测和分析拷贝数变异。源站描述表明,研究采用高分辨率 CNV-seq 技术对脑发育异常儿童样本进行拷贝数变异分析,因此数据内容围绕 CNVs 的检出与基因组结构信息展开。数据集英文名中标注了“CNV-seq”,与源站标题一致,表明其数据类型属于拷贝数变异测序范畴。关于样本数量、变异位点数目、数据文件格式与具体字段构成等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 doi.org,发布机构为 figshare,作者为 Zhu, Shaohua,发布时间为 2025 年。源站描述提及研究对象为脑发育异常儿童,并特别说明该样本仅用于特殊患者。关于样本采集的具体地点、时间跨度、纳入与排除标准、测序平台型号及试剂等信息,源站未提供。

【适用场景】

依据源站描述,该数据集适用于临床遗传学、儿童神经病学以及罕见遗传病转化研究等方向,可用于探究脑发育异常相关的拷贝数变异、提升诊断率并加深对基因组结构的理解。其主题标签指向核酸与蛋白质的医学分子工程领域,也可作为该方向相关研究的参考数据。关于具体的分析流程适配、疾病亚型细分应用等,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件组织方式、分析软件与参数建议等均未在源站描述中体现。使用者需依据数据发布平台 figshare 的常规机制获取数据,并结合 CNV-seq 分析的一般流程进行处理;但该数据集自身的具体使用指引,源站未提供。

【质量与限制】

源站特别说明该样本仅用于特殊患者,提示其适用范围存在特定限制。关于数据质量指标(如测序深度、覆盖度、变异检出灵敏度与特异度)、质控结果、批次效应及验证情况等,源站未提供。数据集在样本规模与代表性方面的具体信息亦未在源站描述中给出,使用时应结合研究目的审慎评估其适用性。

【引用与许可】

该数据集采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可,允许在署名条件下使用与传播。作者为 Zhu, Shaohua,发布机构为 figshare,发布时间为 2025 年,来源站为 doi.org。关于具体的引用格式、DOI 编号及推荐引用文本,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.29669990.v1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在利用高分辨率CNV-seq技术探究脑发育异常儿童的拷贝数变异(CNVs),以提高诊断率并拓展对脑发育异常相关基因组结构的认识。该数据集为临床遗传学、小儿神经病学及罕见遗传病的转化研究提供了宝贵信息。特别声明:本样本仅用于特殊患者

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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