星形胶质细胞介导黑质中紧张性GABA能信号的多巴胺能调控
主题标签:神经系统疾病、黑质、星形胶质细胞、多巴胺能调控、GABA能信号、神经生理学、NWB、BRAIN Initiative

基本信息
资源简介
星形胶质细胞介导黑质中紧张性GABA能信号的多巴胺能调控
该数据集英文名为 Astrocytes mediate the dopaminergic modulation of tonic GABAergic signaling in Substanta nigra,收录于 dandiarchive.org,属于神经系统疾病 / 其他分类。根据源站描述,这是 DANDI Archive 的 dandiset 001777,是一套遵循 NWB 标准的神经生理学数据集,属于 BRAIN Initiative 相关数据,联系人为 Simmons, DeNard。数据集的主题标签包括神经系统疾病、黑质、星形胶质细胞、多巴胺能调控、GABA 能信号、神经生理学、NWB 以及 BRAIN Initiative。整体来看,该数据集围绕黑质区域内星形胶质细胞如何参与多巴胺能调控 tonic GABA 能信号这一神经科学问题,提供标准化的神经生理学数据资源,适合用于神经环路、神经递质调控及相关神经系统疾病机制的研究。
【数据集背景】
该数据集聚焦于黑质(Substanta nigra)区域中星形胶质细胞对多巴胺能调控 tonic GABA 能信号的中介作用。从标题和主题标签可以看出,研究问题涉及神经系统疾病、黑质、星形胶质细胞、多巴胺能调控以及 GABA 能信号等多个神经科学核心概念。黑质是中枢神经系统中与运动控制、奖赏及多种神经系统疾病密切相关的重要脑区,而 tonic GABA 能信号与多巴胺能调控之间的相互作用是理解该区域神经环路功能的关键环节。星形胶质细胞作为中枢神经系统中的重要胶质细胞类型,近年来被认为不仅具有支持作用,还主动参与突触信号调控。该数据集即围绕这一科学问题构建,属于 BRAIN Initiative 框架下的神经生理学数据资源。源站未提供更详细的研究背景说明。
【数据内容】
该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001777。其主题标签涵盖神经系统疾病、黑质、星形胶质细胞、多巴胺能调控、GABA 能信号、神经生理学、NWB 和 BRAIN Initiative。由此可知,数据内容属于神经生理学范畴,并采用 NWB 标准进行组织与存储。NWB 是神经生理学领域常用的数据格式标准,便于数据的共享、复用与跨平台分析。源站未提供具体的记录类型、通道数量、采样率、实验动物种类、样本量或具体实验条件等细节。
【采集与来源】
该数据集来源于 dandiarchive.org,即 DANDI Archive。源站描述显示其为 DANDI Archive 的 dandiset 001777,属于 BRAIN Initiative 相关的 NWB 标准神经生理学数据集,联系人为 Simmons, DeNard。DANDI Archive 是神经生理学数据共享平台,主要收录符合 NWB 标准的数据集。源站未提供具体的采集设备、实验方案、采集时间、采集地点或伦理审批信息。
【适用场景】
基于其主题标签和 NWB 标准属性,该数据集适用于神经生理学相关研究,尤其是涉及黑质、星形胶质细胞、多巴胺能调控和 GABA 能信号的分析。由于标注了神经系统疾病分类,也可能用于与神经系统疾病机制相关的探索性研究。NWB 标准格式使其适合用于数据复用、方法比较以及与其他 NWB 数据集的整合分析。源站未提供具体的适用场景说明或推荐分析流程。
【使用方法】
该数据集以 NWB 标准格式提供,可通过 DANDI Archive 平台获取。使用者可依据 NWB 标准工具链读取和处理数据。源站未提供具体的下载步骤、访问链接、API 调用方式或分析示例。
【质量与限制】
该数据集为 BRAIN Initiative 相关的 NWB 标准神经生理学数据集,来源为 DANDI Archive,具备标准化的数据组织方式。源站未提供质量评估指标、数据完整性说明、已知偏差或使用限制等信息。
【引用与许可】
该数据集的联系人为 Simmons, DeNard。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001777
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DANDI Archive dandiset 001777. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Simmons, DeNard.
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




