15q重复而非Angelman综合征缺失干细胞衍生神经元显著转录变化补充文件1:表S1–S9

主题标签:神经系统疾病、15q重复、Angelman综合征、干细胞衍生神经元、转录变化、RNA表达。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

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基因组分类神经系统疾病15q重复Angelman综合征干细胞衍生神经元转录变化RNA表达
Additional file 1: Tables S1–S9. of Significant transcriptional changes in 15q duplication but not Angelman syndrome deletion stem cell-derived neurons

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

15q重复而非Angelman综合征缺失干细胞衍生神经元显著转录变化补充文件1:表S1–S9

本数据集为一份公开的科研补充材料,英文名称为“Additional file 1: Tables S1–S9. of Significant transcriptional changes in 15q duplication but not Angelman syndrome deletion stem cell-derived neurons”,来源于springernature.figshare.com。其主题涉及神经系统疾病、15q重复、Angelman综合征、干细胞衍生神经元、转录变化及RNA表达等方向,属于神经系统疾病/其他分类下的公开数据集。该数据集由Urraca、Hope、Victor、Belgard、Memon、Goorha、Valdez、Tran、Sanchez、Ramirez、Donaldson、Bridges、Reiter等作者于2018年发布,以补充材料形式呈现,包含表S1至S9,聚焦于15q重复而非Angelman综合征缺失的干细胞衍生神经元中显著的转录变化。

【数据集背景】

该数据集属于神经系统疾病研究领域,具体围绕15q重复与Angelman综合征两种遗传状态展开。研究关注的是干细胞衍生神经元中的转录变化,试图区分15q重复与Angelman综合征缺失在基因表达层面的不同表现。从标题可知,重点在于“15q重复中显著、而Angelman综合征缺失中不显著”的转录变化,这为理解两种疾病的分子机制差异提供了数据基础。数据集以补充材料形式发布,编号为Additional file 1,内含表S1至S9,是相关研究论文的配套数据集合。

【数据内容】

数据集的核心内容为表S1至S9,这些表格记录了干细胞衍生神经元中显著的转录变化。主题标签涵盖神经系统疾病、15q重复、Angelman综合征、干细胞衍生神经元、转录变化、RNA表达。由此可知,数据涉及RNA表达层面的转录组信息,并以表格形式组织。具体每张表包含哪些字段、多少行记录、采用何种统计指标,源站未提供。数据集英文名中“Significant transcriptional changes”表明表格内容经过显著性筛选,但显著性阈值、检验方法等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为springernature.figshare.com,发布年份为2018年,作者包括Urraca, Nora、Hope, Kevin、Victor, A.、Belgard, T.、Memon, Rawaha、Goorha, Sarita、Valdez, Colleen、Tran, Quynh、Sanchez, Silvia、Ramirez, Juanma、Donaldson, Martin、Bridges, Dave、Reiter, Lawrence。数据集DOI为http://doi.org/10.6084/m9.figshare.5830542.v1。关于样本来源、细胞培养条件、测序平台、数据处理流程等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病相关研究,尤其是15q重复与Angelman综合征的分子机制比较研究。由于内容聚焦于干细胞衍生神经元的转录变化,可服务于转录组分析、差异表达验证、候选基因筛选等场景。主题标签中的RNA表达提示其可用于基因表达层面的探索。具体适用场景的边界与推荐用途,源站未提供。

【使用方法】

数据集以补充材料表格形式提供,用户可通过来源站获取。关于如何下载、解析、整合这些表格,以及是否需要配合主论文使用,源站未提供。数据格式、编码方式、是否提供元数据说明等,源站未提供。

【质量与限制】

数据集为2018年发布的补充材料,具体质量控制措施、样本量、重复数、统计效力、潜在批次效应等信息,源站未提供。由于仅包含表S1至S9,可能不包含原始测序数据或完整分析代码。使用时应结合原始论文理解上下文。其他质量与限制信息,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,应参考作者列表及DOI:Urraca, Nora; Hope, Kevin; Victor, A.; Belgard, T.; Memon, Rawaha; Goorha, Sarita; Valdez, Colleen; Tran, Quynh; Sanchez, Silvia; Ramirez, Juanma; Donaldson, Martin; Bridges, Dave; Reiter, Lawrence (2018). Additional file 1: Tables S1–S9. of Significant transcriptional changes in 15q duplication but not Angelman syndrome deletion stem cell-derived neurons [Dataset]. http://doi.org/10.6084/m9.figshare.5830542.v1。关于许可条款、使用限制、商业用途规定等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_Tables_S1_S9_of_Significant_transcriptional_changes_in_15q_duplication_but_not_Angelman_syndrome_deletion_stem_cell-derived_neurons/5830542

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数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Urraca, Nora; Hope, Kevin; Victor, A.; Belgard, T.; Memon, Rawaha; Goorha, Sarita; Valdez, Colleen; Tran, Quynh; Sanchez, Silvia; Ramirez, Juanma; Donaldson, Martin; Bridges, Dave; Reiter, Lawrence (2018). Additional file 1: Tables S1–S9. of Significant transcriptional changes in 15q duplication but not Angelman syndrome deletion stem cell-derived neurons [Dataset]. http://doi.org/10.6084/m9.figshare.5830542.v1

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