AIBS非人灵长类膜片钳测序数据集

该数据集属于神经系统疾病领域,采用 NWB 标准格式组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关。从主题上看,该数据集涵盖神经系统疾病方向,可为相关领域的研究人员提供公开可用的数据资源

dandi
2025-05-30 更新
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20250627_AIBS_Patchseq_nonhuman_primate

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2025-05-30
版本
0.250627.1703

资源简介

AIBS非人灵长类膜片钳测序数据集

20250627_AIBS_Patchseq_nonhuman_primate 是一个公开的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001465。该数据集属于神经系统疾病领域,采用 NWB 标准格式组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关。数据集的联系人为 Gonzalez, Limary。从主题上看,该数据集涵盖神经系统疾病方向,可为相关领域的研究人员提供公开可用的数据资源。该数据集来源于 dandiarchive.org,属于神经系统疾病分类下的“其他”子类。以下将从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集英文名为 20250627_AIBS_Patchseq_nonhuman_primate,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001465。DANDI Archive 是面向神经科学领域的公开数据归档平台,该数据集被标注为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。数据集在分类上属于神经系统疾病领域,具体归入“其他”类别。其联系人为 Gonzalez, Limary。以上信息表明,该数据集面向神经生理学与神经系统疾病研究方向,以标准化格式对外发布。

【数据内容】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集。源站描述中提及该数据集与 BRAIN Initiative 相关,并给出了 DANDI Archive 的 dandiset 编号 001465。数据集名称中包含 Patchseq 与 nonhuman primate 字样,但源站未提供关于具体数据内容、记录模态、样本数量、物种明细、脑区、细胞类型或实验条件的进一步说明。除上述信息外,源站未提供更多关于数据内容的具体描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,即 DANDI Archive,dandiset 编号为 001465。源站描述将其标注为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。数据集的联系人为 Gonzalez, Limary。关于具体的采集机构、采集设备、实验方案、采集时间与地点等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集属于神经系统疾病领域,主题涵盖神经系统疾病,并以 NWB 标准格式发布神经生理学数据。基于这些信息,该数据集可用于神经系统疾病相关的神经生理学研究场景。由于源站未提供更具体的数据内容说明,关于该数据集可支持的具体分析任务、研究问题或应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准格式组织,发布在 DANDI Archive 上,dandiset 编号为 001465。使用者可通过 DANDI Archive 获取该数据集。关于具体的数据下载方式、访问流程、读取工具、依赖环境或使用步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 上的公开数据集,采用 NWB 标准格式,并与 BRAIN Initiative 相关。关于数据质量评估、数据完整性、标注准确性、覆盖范围或使用限制等信息,源站未提供。使用者如需了解该数据集在质量与限制方面的具体情况,应参考源站的相关说明。

【引用与许可】

该数据集来源于 dandiarchive.org,dandiset 编号为 001465,联系人为 Gonzalez, Limary。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用条件或授权范围等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001465

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001465. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Gonzalez, Limary.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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