强直性肌营养不良1型中发现的r(CCGCUGCGG)2 UU内部环结构数据集 - 含两个氢键对的UU配对
该数据集包含通过溶液核磁共振方法测定的RNA结构数据，具体为在强直性肌营养不良1型中发现的r(CCGCUGCGG)2序列UU内部环的三维构象，详细记录了含两个氢键对的UU配对结构，主要用于RNA二级结构研究、分子动力学模拟以及强直性肌营养不良等神经肌肉疾病的分子机制探索，为疾病相关RNA异常结构提供结构生物学基础。
基本信息
资源简介
强直性肌营养不良1型中发现的r(CCGCUGCGG)2 UU内部环结构数据集 - 含两个氢键对的UU配对
【数据集背景】
本数据集源站标题为《r(CCGCUGCGG)2 UU Internal Loop Found in Myotonic Dystrophy Type 1 - UU pair with two hydrogen bond pairs》。
【数据内容】
源站原始描述：UU mismatch, RNA
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.1021/bi101896j。
【主题与分类】
主题标签：RNA。
【获取与许可】
源站页面：https://www.rcsb.org/structure/2L8W
规范引用：NMR Spectroscopy and Molecular Dynamics Simulation of r(CCGCUGCGG)(2) Reveal a Dynamic UU Internal Loop Found in Myotonic Dystrophy Type 1. (2011) Biochemistry
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://pdbj.org/mine/summary/2l8w
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是来自Protein Data Bank Japan的RNA结构数据集，具体包含在强直性肌营养不良1型（Myotonic Dystrophy Type 1）中发现的r(CCGCUGCGG)2 UU内部环结构的三维构象信息。数据通过溶液核磁共振（SOLUTION NMR）方法测定，详细记录了RNA序列5’‘-R(CPCPGPCPUPGPCPGP*G)-3’'的UU配对结构，该配对包含两个氢键对。该数据集主要用于研究RNA二级结构、分子动力学模拟以及强直性肌营养不良等神经肌肉疾病的分子机制研究，为理解疾病相关RNA异常结构提供结构生物学基础。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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