GSE156583:EAE高峰期星形胶质细胞网络的RABID转录组

数据为B6小鼠EAE模型中星形胶质细胞网络的RABID转录组,包含1个文件(GSE156583_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,平台为GPL21626,物种为10090(小鼠)

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基因组GPL2162610090
GSE156583: RABID transcriptome from peak EAE astrocyte networks

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE156583:EAE高峰期星形胶质细胞网络的RABID转录组

GSE156583 数据集收录的是 B6 小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中星形胶质细胞网络的 RABID 转录组数据。该数据集归类于神经系统疾病与多发性硬化方向,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,由 Michael A. Wheeler 提交,发布时间为 Aug 20 202(原文如此)。数据集共包含 1 个文件,即 GSE156583_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL21626,物种为小鼠(10090)。整体而言,该数据面向星形胶质细胞网络在 EAE 病程中的转录组特征研究,适合作为神经免疫与多发性硬化相关表达谱分析的基础资源。

【数据集背景】

该数据集的主题为“RABID transcriptome from peak EAE astrocyte networks”,源站描述为“Tracing astrocyte networks in EAE in B6 mice”。从标题与描述可以看出,数据聚焦于 B6 小鼠 EAE 模型中星形胶质细胞网络的追踪与转录组刻画,属于神经系统疾病尤其是多发性硬化研究范畴。EAE 是多发性硬化研究中常用的动物模型,星形胶质细胞网络在其中的状态变化是该数据集关注的核心对象。数据集以表达谱分析为主要目的,采用高通量测序技术获取转录组信息。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件名为 GSE156583_series_matrix.txt.gz,为 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件承载的是高通量测序表达谱分析的结果矩阵,对应平台 GPL21626,物种为小鼠(10090)。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21626 与 10090,分别指向测序表达谱方法、芯片/测序平台编号与物种编号。数据内容围绕 B6 小鼠 EAE 模型中星形胶质细胞网络的 RABID 转录组展开,未提供更多关于样本数量、分组或具体基因层面的细节。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Michael A. Wheeler,发布时间为 Aug 20 202。源站标题为“RABID transcriptome from peak EAE astrocyte networks”,源站描述为“Tracing astrocyte networks in EAE in B6 mice”。数据集的实验对象为 B6 小鼠的 EAE 模型,采集内容为星形胶质细胞网络的转录组。关于具体的实验流程、测序深度、样本处理与伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病特别是多发性硬化方向的表达谱研究,可用于了解 B6 小鼠 EAE 模型中星形胶质细胞网络的转录组特征。由于采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL21626,物种为小鼠,适合作为相关比较分析或方法验证的参考数据。其单文件系列矩阵形式也便于在本地环境中进行读取与初步探索。关于更具体的分析用途与结论,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE156583_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅包含 1 个系列矩阵文件,读取时应关注矩阵中的表达值字段与注释信息是否完整。关于平台注释文件、标准化方法与推荐分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,未提供样本层面的重复信息、质控指标或批次信息,源站亦未提供相关质量评估说明。发布时间标注为 Aug 20 202,年份信息不完整。使用时应以文件内实际字段为准,并在小样本核对阶段确认编码与格式无误。关于数据完整性、缺失值处理与潜在偏倚,源站未提供。

【引用与许可】

数据集的作者为 Michael A. Wheeler,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。使用者在引用或再分发时应自行核实源站的相关政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE156583

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Tracing astrocyte networks in EAE in B6 mice

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