phs000339:线粒体OXPHOS疾病MitoExome测序(MGH)

数据聚焦线粒体OXPHOS疾病,本站归类于神经系统疾病与代谢性肌病,主题标签为Case Set。可用于围绕线粒体氧化磷酸化相关疾病的病例集合开展分类等分析,具体样本量、测序平台、覆盖范围及可用字段源站未提供(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case Set
phs000339: MitoExome Sequencing of Mitochondrial OXPHOS Diseases (MGH)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

phs000339:线粒体OXPHOS疾病MitoExome测序(MGH)

phs000339: MitoExome Sequencing of Mitochondrial OXPHOS Diseases (MGH) 是一个聚焦线粒体氧化磷酸化(OXPHOS)相关疾病的病例集合数据集,收录于 NCBI 的 dbGaP 研究档案中,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在本站被归类于神经系统疾病与代谢性肌病两个方向,主题标签为 Case Set,表明其核心组织方式是以病例为单位进行汇集。从命名中的 MitoExome 可以理解,该研究关注的是与线粒体功能相关的编码区域测序信息,而 MGH 通常指向马萨诸塞总医院这一研究机构背景。整体而言,该数据集为研究线粒体 OXPHOS 疾病提供了以病例集合为基础的资源入口,可用于围绕此类疾病开展分类等分析工作。需要说明的是,关于样本量、测序平台、覆盖范围以及可用字段等具体技术细节,源站未提供,因此本介绍仅能就已知的归类、来源与主题定位进行说明。

【数据集背景】

线粒体氧化磷酸化是细胞能量代谢的核心过程,其功能障碍可导致一组临床表现高度异质的疾病,常同时累及神经系统和肌肉组织,因此在本站分类中同时归入神经系统疾病与代谢性肌病。phs000339 这一研究以 MitoExome Sequencing 为技术切入点,针对 Mitochondrial OXPHOS Diseases 展开,研究地点标识为 MGH。该数据集在 dbGaP 中被标注为 Case Set,说明其设计定位是病例样本的集合,而非一般人群对照或家系全貌。此类以病例为核心的资源,通常用于探索与线粒体 OXPHOS 缺陷相关的遗传变异谱和表型关联,但具体的研究假设、纳入排除标准以及招募策略,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Case Set,意味着其内容组织围绕病例展开。数据集名称中的 MitoExome 提示其数据可能涉及线粒体相关基因的外显子区域测序,但具体的基因列表、目标区域边界、变异类型(如点突变、插入缺失或拷贝数变异)以及注释信息,源站未提供。同样,数据集内是否包含临床表型字段、家族史、发病年龄、肌肉活检结果或生化指标等,源站未提供。因此,无法就数据内容的粒度、维度或具体变量进行进一步描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究档案中的一个 study,源站对其的描述为 dbGaP study (Case Set)。研究名称中标注的 MGH 指向样本或研究开展所在的机构背景。除上述来源与机构标识外,关于样本采集地点、采集时间跨度、知情同意方式、伦理审批信息以及测序服务的具体执行方,源站未提供。

【适用场景】

基于其病例集合的定位和线粒体 OXPHOS 疾病的主题,该数据集可用于围绕线粒体氧化磷酸化相关疾病的病例集合开展分类等分析。例如,在方法学层面,可将其作为病例组资源,用于探索疾病亚型划分、候选基因筛选或变异负荷比较等研究方向。由于本站将其归类于神经系统疾病与代谢性肌病,相关分析也可在这两个疾病范畴内展开。然而,任何涉及具体统计功效、样本代表性或对照比较的设计,均需依赖源站未提供的样本量与字段信息,因此当前无法就适用场景的边界给出更具体的说明。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI 的 dbGaP 平台发布,属于受控访问的研究档案。通常,使用者需要遵循 dbGaP 的数据访问流程,包括提交数据使用申请、获得相应授权后方可获取数据。但关于本数据集的具体访问级别、申请条件、下载格式、配套文档以及是否需要额外的数据使用协议,源站未提供。因此,无法就实际操作步骤、所需工具或分析流程给出进一步指引。

【质量与限制】

该数据集在源站被标注为 dbGaP study (Case Set),其质量相关信息如测序深度、覆盖均一性、变异检出灵敏度与特异性、样本重复或污染控制等,源站未提供。限制方面,由于缺乏样本量、测序平台和覆盖范围等关键参数,无法评估其统计效力或外推能力。此外,数据集仅以病例集合形式呈现,是否包含对照、是否支持病例对照比较,源站未提供。因此,使用者在依赖该数据集得出结论前,需自行核实源站的最新文档与质控报告。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究档案。关于具体的引用格式、文献出处、数据生产者名单、许可条款以及使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应直接查阅 dbGaP 上该研究对应的官方页面,以获取准确的引用要求和许可信息。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000339

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数据说明

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