儿童脊髓低级别胶质瘤甲基化数据

该数据集为儿童脊髓低级别胶质瘤的甲基化芯片原始数据,包含idats文件形式的分子病理数据,通过在线平台分析可获得甲基化类别预测与拷贝数变异信息,主要用于研究这一罕见肿瘤亚型的分子异质性、分型及生物标志物探索,适用于儿童神经肿瘤学与分子病理学领域。

Mendeley Data
2024-03-27 更新
浏览 40
分子病理学儿童脊髓胶质瘤
Pediatric Spinal Cord Low-Grade Gliomas Methylation Data

基本信息

大小
0.601774708 GB
创建/更新时间
2024-03-27
版本
v1

资源简介

儿童脊髓低级别胶质瘤甲基化数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Pediatric spinal cord low-grade gliomas methylation data》。源站首次发布:2022-09-02。

【数据内容】

源站原始描述:This dataset consists of methylation array raw data (idats) from pediatric spinal.cord glioma patients. We aimed to study itertumoral heterogeneity in this rare subtype of pediatric gliomas. We performed analysis using www.molecularneuropathology.org website to achieve Methylation class prediction (with calibrated scores) and copy number variation data

【数据结构与技术规格】

文件数 44 个,合计 601.77 MB。数据集 DOI:10.17632/xzkgt4jvm2.1。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/xzkgt4jvm2

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源站:https://data.mendeley.com/datasets/xzkgt4jvm2

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自儿童脊髓胶质瘤患者的甲基化芯片原始数据(idats文件),旨在研究这一罕见儿科胶质瘤亚型的肿瘤间异质性。数据通过www.molecularneuropathology.org网站进行分析,以获取甲基化类别预测(含校准分数)和拷贝数变异数据。该数据集适用于分子病理学、儿童神经肿瘤学等领域的研究,可用于探索肿瘤分子分型、异质性及潜在生物标志物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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