低级别胶质瘤与胶质母细胞瘤中lncRNA的表达:一项计算机分析

该数据集是一个基于TCGA等公开RNA测序数据的生物信息学资源,包含超过650个脑癌样本和70个正常脑组织的lncRNA表达谱,涉及低级别胶质瘤和胶质母细胞瘤的多种亚型。数据模态主要为基因表达数据(文本/表格形式),通过识别特异性表达的lncRNA并构建生存模型,旨在探索lncRNA在脑癌发生、发展及预后中的作用,为癌症生物信息学、神经肿瘤学研究和分子标志物发现提供支持。

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2016-12-07 更新
浏览 30
brain tumor progressionbrain cancerlncRNALong noncoding RNAsHRGBMTCGAsurvival algorithmSilico Analysis BackgroundIDHCICancer Genome Atlas
Expression of lncRNAs in Low-Grade Gliomas and Glioblastoma Multiforme: An In Silico Analysis

基本信息

大小
0.019510216 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-12-07
版本
v1

资源简介

低级别胶质瘤与胶质母细胞瘤中lncRNA的表达:一项计算机分析

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Expression of lncRNAs in Low-Grade Gliomas and Glioblastoma Multiforme: An In Silico Analysis》。配套论文《Expression of lncRNAs in Low-Grade Gliomas and Glioblastoma Multiforme: An In Silico Analysis》发表于 PLOS Medicine(2016),DOI:10.1371/journal.pmed.1002192。源站首次发布:2016-12-06。

【数据内容】

源站原始描述:Background Each year, over 16,000 patients die from malignant brain cancer in the US. Long noncoding RNAs (lncRNAs) have recently been shown to play critical roles in regulating neurogenesis and brain tumor progression. To better understand the role of lncRNAs in brain cancer, we performed a global analysis to identify and characterize all annotated and novel lncRNAs in both grade II and III gliomas as well as grade IV glioblastomas (glioblastoma multiforme [GBM]). Methods and Findings We determ…

【数据结构与技术规格】

文件数 13 个,合计 19.51 MB。S1 Fig.tiff:image/tiff,3.69 MB。S2 Fig.tiff:image/tiff,3.69 MB。S3 Fig.tiff:image/tiff,3.69 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pmed.1002192。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:brain tumor progression、brain cancer、lncRNA、Long noncoding RNAs、HR、GBM、multivariate Cox regression survival model、TCGA、survival algorithm、Silico Analysis Background。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Biological Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Expression_of_lncRNAs_in_Low-Grade_Gliomas_and_Glioblastoma_Multiforme_An_In_Silico_Analysis/4291787

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:J. Reon, Brian; Anaya, Jordan; Zhang, Ying; Mandell, James; Purow, Benjamin; Abounader, Roger; et al. (2016). Expression of lncRNAs in Low-Grade Gliomas and Glioblastoma Multiforme: An In Silico Analysis. PLOS Medicine. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-03,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/Expression_of_lncRNAs_in_Low-Grade_Gliomas_and_Glioblastoma_Multiforme_An_In_Silico_Analysis/4291787

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数据说明

该数据集是一个专注于脑癌研究的生物信息学数据集,主要分析低级别胶质瘤(LGG)和胶质母细胞瘤(GBM)中长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱。数据集基于来自癌症基因组图谱(TCGA)等公开资源的超过650个脑癌样本和70个正常脑组织的RNA测序数据,识别了611个诱导和677个抑制的lncRNA,并揭示了这些lncRNA在不同胶质瘤亚型(如IDH1/2突变型、1p19q共缺失型以及GBM的经典、间充质、神经和前神经亚型)中的特异性表达。通过多变量Cox回归生存模型,确定了584个与不良预后和282个与良好预后相关的lncRNA,并开发了一个基于64个lncRNA表达的生存算法,用于预测患者预后。该数据集为研究lncRNA在脑癌发生、发展和预后中的作用提供了关键资源,适用于癌症生物信息学、神经肿瘤学以及分子标志物发现等领域。

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