婴儿高级别胶质瘤(基因融合)数据集
婴儿高级别胶质瘤多亚组基因融合与生存率研究基因组数据集。

基本信息
资源简介
婴儿高级别胶质瘤(基因融合)数据集
【一句话概览】
婴儿高级别胶质瘤包含多个亚组,以新型可靶向基因融合和更好生存为特征。甲基化芯片分析识别出一个内在肿瘤群,其表观遗传谱不同于年龄较大儿童的胶质瘤。这些肿瘤复发突变极少,融合基因频率很高;可依据甲基化谱诊断,并已有针对不同融合基因的新型治疗(来源 BioStudies)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Infant high grade gliomas comprise multiple subgroups characterised by novel targetable gene fusions and better survival》。
【数据内容】
源站原始描述:Methylation array profiling of infant high grade gliomas identifies an intrinsic group of tumours with epigenetic profiles distinct from gliomas in older children. These tumours are characterised by very few recurrent mutations and carry a very high frequency of fusion genes. They can be diagnosed according to their methylation profile and novel treatments are available targeting the different fusion genes
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):婴儿高级别胶质瘤的甲基化微阵列分析识别出一个固有肿瘤组,其表观遗传学特征与年龄较大的儿童胶
【主题与分类】
主题标签:methylation profiling by array、Cell line - Methylation microarray、Homo sapiens。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-MTAB-7804
下载信息
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源站:https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-MTAB-7804
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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