用于ALS/FTD精准医学的从头隐蔽剪接创建

面向ALS/FTD精准医学的TDP-REG隐蔽剪接平台研究,利用深度学习设计剪接传感器并在病变细胞中特异性表达治疗蛋白。

NIAID Data Ecosystem
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多模态ALS/FTD隐蔽剪接
Creation of de novo cryptic splicing for ALS/FTD precision medicine

基本信息

模态
多模态
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

该数据集围绕TDP-REG精准医学平台,面向肌萎缩侧索硬化(ALS)和额颞叶痴呆(FTD),利用TDP-43功能缺失(TDP-LOF)细胞中发生的隐蔽剪接事件,驱动治疗蛋白在病变细胞中特异性表达。内容涉及改造现有隐蔽外显子、开发基于深度学习的可定制隐蔽剪接事件生成算法、构建荧光/发光报告系统、开展TDP-LOF依赖的基因组prime editing(靶向UNC13A隐蔽供体位点),以及设计编码TDP-43/Raver1融合蛋白的自调控载体以挽救关键病理剪接事件。方法包括细胞培养、Western blotting、His标签pull-down、克隆等,数据可视化使用R。用途为神经退行性疾病的精准治疗与潜在预防性治疗研究。

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