Chiari畸形CDE数据标准
Chiari I Malformation Common Data Elements 面向小脑扁桃体下疝畸形及相关临床研究,提供公开可访问的文本数据、标注或队列信息,适合用于分类、疾病表型分层、结构测量、风险预测和医学AI模型基准测试。

基本信息
资源简介
Chiari畸形CDE数据标准
【一句话概览】
2016年,首个Chiari I畸形(CM1)通用数据元素(CDEs)与Bobby Jones Chiari与脊髓空洞症基金会合作开发。其目的是为既往常用的研究变量提供标准定义,促进研究在现有文献中更统一地使用。该CDE及工具清单不限制对其他变量的考察,仅尽可能标准化常用变量。软组织、脑脊液体积与形态及动态生理指标等尚未纳入,因缺乏标准化方法,希望未来版本纳入。这些CDEs不用于定义CM1本身或指导手术,仅为研究工具(来源 commondataelements.ninds.nih.gov)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Chiari I Malformation》。
【数据内容】
源站原始描述:The first set of Common Data Elements (CDEs) for CM1 was developed in partnership with the Bobby Jones Chiari & Syringomyelia Foundation in 2016. The purpose of the Chiari I Malformation Common Data Elements (CDEs) is to facilitate research by providing a standard definition for common, previously used research variables so that they may be used in a more uniform fashion across the available literature. The listing of Common Data Element and Instrument definitions and tools is not intended to li…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):首套针对CM1的通用数据元素(CDEs)于2016年与Bobby Jones Chiari & Syringomyelia基金会合作开发。Chiari I型畸形通用数据元素(CDEs)旨在通过为既往常用的研究变量提供标准定义,促进研究,以便在现有文献中更统一地使用这些变量。列出通用数据元素和工具定义及工具,并非意在限制对Chiari I型畸形研究中任何其他变量的考虑,而仅是为了在可能的情况下标准化常用变量的使用。例如,我们认识到,其他指标,特别是涉及软组织和脑脊液体积与形状特征的指标,或涉及动态生理测量的指标,可能对未来的Chiari研究很重要,也许最终对其评估和治疗也很重要。这些指标尚未纳入本版Chiari I型畸形CDEs,因为目前尚无可用的标准化方法。我们希望这些元素能成为未来版本CDEs的一部分,以进一步推动文献发展。最后,我们应谨记,这些CDEs的目的不是定义Chiari I型畸形本身或指导手术治疗;这些CDEs是用于研究目的的工具。
【主题与分类】
主题标签:Chiari I Malformation、Common Data Elements、NINDS、Clinical Research、Data Standards。
【适用方向】
文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。
【获取与许可】
源站页面:https://commondataelements.ninds.nih.gov/Chiari%20I%20Malformation
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://commondataelements.ninds.nih.gov/Chiari%20I%20Malformation
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Chiari I Malformation Common Data Elements 是与小脑扁桃体下疝畸形相关的公开数据集,包含文本数据,可用于分类、表型识别、疾病评估或算法验证。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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