多维度解析共济失调中编码与非编码基因融合及靶向嵌合蛋白
该数据集包含来自1443个样本的RNA测序数据，涵盖细胞模型、小鼠模型、共济失调患者样本和健康对照，主要研究基因融合事件在共济失调发病中的作用。通过识别新型基因融合、分析嵌合蛋白结构变化以及探索非编码RNA融合的调控机制，为理解疾病病理和开发靶向治疗提供了多模态（基因序列、蛋白质结构、药物分子）的研究基础。
创建时间2024-03-05
更新时间2025-09-29
原始链接
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/A_multi-faceted_approach_to_unravel_coding_and_non-coding_gene_fusions_and_target_chimeric_proteins_in_ataxia/25295959
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资源简介
该数据集聚焦于共济失调（一种以平衡和协调能力丧失为特征的神经退行性疾病）中的基因融合事件。研究基于1443个样本的RNA测序数据，包括细胞模型、小鼠模型、患者样本和健康对照，识别出7067个新型基因融合，并分析了其可能通过产生嵌合蛋白、破坏基因调控或引入新功能来影响疾病发生。通过AI蛋白质结构预测，揭示了TEN1-ACOX1、PEX14-NMNAT1和ITPR1-GRID2等高置信度融合蛋白的拓扑结构变化，并利用虚拟药物筛选和分子动力学模拟鉴定了潜在的治疗分子。此外，还探索了非编码RNA融合（如RP11-547P4-FLJ33910）作为miRNA海绵的作用机制。该数据集为理解共济失调的发病机制和开发靶向治疗提供了重要资源。
提供机构：Karagoz, Mustafa Safa; Ozturk, Merve Tuzlakoglu; Ozcelik, Emrah; Tazebay, Uygar Halis; Gullulu, Omer
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