早期阿尔茨海默病同源脑类器官单细胞RNA测序数据集
该数据集包含来自三种同源细胞系的人脑类器官的单细胞RNA测序数据,三种细胞系仅疾病相关遗传变异不同:野生型对照、携带与散发性阿尔茨海默病相关的突变APOE4等位基因的细胞系,以及携带与家族性阿尔茨海默病相关的PSEN1突变的细胞系

基本信息
资源简介
早期阿尔茨海默病同源脑类器官单细胞RNA测序数据集
Single-cell RNA sequencing of isogenic cerebral organoid models of early Alzheimer's disease development
该数据集包含来自三种同源细胞系的人脑类器官的单细胞RNA测序数据,三种细胞系仅疾病相关遗传变异不同:野生型对照、携带与散发性阿尔茨海默病相关的突变APOE4等位基因的细胞系,以及携带与家族性阿尔茨海默病相关的PSEN1突变的细胞系。类器官在早期发育时间点(第0、6、9和12天)进行分析,以捕获与阿尔茨海默病相关表型最早阶段相关的转录变化。记录包括原始测序读段(FASTQ)、未过滤计数矩阵、带有运行参数的处理后单细胞对象以及质量控制报告(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自三种同源细胞系的人脑类器官的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,这三种细胞系仅疾病相关遗传变异不同:野生型对照、携带与散发性阿尔茨海默病相关的突变APOE4等位基因的细胞系,以及携带与家族性阿尔茨海默病相关的PSEN1突变的细胞系。类器官在早期发育时间点(第0、6、9和12天)进行分析,以捕获与阿尔茨海默病相关表型最早阶段相关的转录变化。记录包括原始测序读段(FASTQ)、未过滤计数矩阵、带有运行参数的处理后单细胞对象以及质量控制报告。
【主题与分类】
主题标签:Cell biology。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://datarepo.eosc.cz/doi/10.48700/bt0hj-m4652
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.48700/bt0hj-m4652
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来源于三种同基因细胞系的人脑类器官的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,这三种细胞系仅在与疾病相关的遗传变异上有所不同:一种为野生型对照,一种携带与散发性阿尔茨海默病相关的突变APOE4等位基因,另一种携带与家族性阿尔茨海默病相关的PSEN1突变。在早期发育时间点(第0、6、9和12天)对类器官进行了分析,以捕获与阿尔茨海默病相关表型最早阶段相关的转录变化。该记录包括原始测序读段(FASTQ)、未过滤的计数矩阵、带有运行参数的处理后单细胞对象以及质量控制报告。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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