阿尔茨海默病脑类器官发育单细胞RNA测序图谱

该数据集为阿尔茨海默病脑类器官发育的单细胞RNA测序图谱,涵盖来自9个独立细胞系的类器官(3个野生型健康对照系和6个源自阿尔茨海默病患者或AD相关来源的细胞系),在8个发育时间点(第0、6、12、18、30、60、90和120天)进行纵向采样,以捕捉细胞组成和基因表达的动态变化

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基因组分类Cell biology
Single-cell RNA sequencing atlas of Alzheimer's disease cerebral organoid development

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

阿尔茨海默病脑类器官发育单细胞RNA测序图谱

Single-cell RNA sequencing atlas of Alzheimer's disease cerebral organoid development

该数据集为阿尔茨海默病脑类器官发育的单细胞RNA测序图谱,涵盖来自9个独立细胞系的类器官(3个野生型健康对照系和6个源自阿尔茨海默病患者或AD相关来源的细胞系),在8个发育时间点(第0、6、12、18、30、60、90和120天)进行纵向采样,以捕捉细胞组成和基因表达的动态变化。数据包含原始测序reads(FASTQ)、未过滤计数矩阵、带运行参数的处理后单细胞对象及质控报告,可用于研究AD相关转录变化及类器官发育过程(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集是人类脑类器官发育的单细胞RNA测序(scRNA-seq)图谱,表征与阿尔茨海默病(AD)相关的转录变化。该图谱包含源自九个独立细胞系的类器官——三个野生型(健康对照)系和六个源自阿尔茨海默病患者或AD相关来源的系——在八个发育时间点(第0、6、12、18、30、60、90和120天)进行分析,以捕捉类器官发育过程中细胞组成和基因表达的纵向变化。该记录包括原始测序reads(FASTQ)、未过滤计数矩阵、带运行参数的处理后单细胞对象以及质量控制报告。

【主题与分类】

主题标签:Cell biology。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://datarepo.eosc.cz/doi/10.48700/1zspr-v3p77

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是人类脑类器官发育的单细胞RNA测序(scRNA-seq)图谱,用于表征与阿尔茨海默病(AD)相关的转录变化。该图谱包含源自九个独立细胞系的类器官——三个野生型(健康对照)细胞系和六个源自阿尔茨海默病患者或AD相关来源的细胞系——在八个发育时间点(第0、6、12、18、30、60、90和120天)进行 profiling,以捕捉类器官发育过程中细胞组成和基因表达的纵向变化。该记录包括原始测序reads(FASTQ)、未过滤的计数矩阵、带有运行参数的处理后单细胞对象以及质量控制报告。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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