白色念珠菌对多聚谷氨酰胺聚集及毒性的抗性

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003916

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

蛋白质质量控制的破坏可能是有害的，会对单细胞生物产生毒性作用，并在人类中引起阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病等神经退行性疾病。在此，我们研究了聚谷氨酰胺（polyQ）聚集在人类主要真菌病原体白色念珠菌（Candida albicans）中的影响，旨在寻找使这种真菌失活的新方法。然而，我们发现表达长达230Q的聚谷氨酰胺（polyQ）片段对白色念珠菌生长和耐受蛋白质毒性应激的能力没有影响。生物信息学分析表明，白色念珠菌具有与单细胞真菌酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）相似的富含谷氨酰胺的蛋白质组，而酿酒酵母仅需72Q即可表现出polyQ毒性。令人惊讶的是，全局转录谱显示，在诱导至多达230Q时没有显著变化。蛋白质组学分析突出显示了230Q的两个关键相互作用蛋白Sis1和Sgt2，然而，缺失任一蛋白并未对白色念珠菌的毒性产生额外影响。我们的数据表明，白色念珠菌已进化出强大的机制来克服易聚集蛋白，为研究polyQ相关疾病提供了独特模型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。