APOE ε4 人类小胶质细胞与星形胶质细胞中胆固醇及基质体通路失调 [mouseApoe]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 786226），主题为转录组或基因表达，聚焦 APOE ε4 背景下人类小胶质细胞与星形胶质细胞中胆固醇及基质体通路的失调，并包含小鼠 Apoe 相关数据
![PRJNA786226: Cholesterol and matrisome pathways dysregulated in APOE ε4 human microglia and astrocytes [mouseApoe]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/73222.jpg)
基本信息
资源简介
APOE ε4 人类小胶质细胞与星形胶质细胞中胆固醇及基质体通路失调 [mouseApoe]
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号 786226，英文名称为“Cholesterol and matrisome pathways dysregulated in APOE ε4 human microglia and astrocytes [mouseApoe]”。其主题标签为转录组或基因表达，属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病相关分类。项目聚焦于 APOE ε4 背景下人类小胶质细胞与星形胶质细胞中胆固醇及基质体通路的失调，并包含小鼠 Apoe 相关数据。作为 BioProject 记录，它汇集了与单一研究计划相关的多种生物数据，便于用户在一个入口下查找该项目产生的不同类型数据及其链接。该数据集可用于探索 APOE ε4 对神经胶质细胞转录状态的影响，以及胆固醇与基质体通路在阿尔茨海默病相关机制中的潜在作用。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 786226。BioProject 是围绕单一研究计划或由单一组织、联盟发起的生物数据集合，其记录为用户提供统一入口，以查找该项目产生的多种数据类型。该项目的标题明确指出研究重点为 APOE ε4 背景下人类小胶质细胞与星形胶质细胞中胆固醇和基质体通路的失调，并包含小鼠 Apoe 相关数据。本站将其归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向，主题标签为转录组或基因表达。由此可知，该项目处于神经退行性疾病、特别是阿尔茨海默病相关研究的背景下，关注 APOE ε4 这一重要遗传风险因素在胶质细胞中的作用。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据类型与转录组或基因表达相关。项目标题涉及人类小胶质细胞与星形胶质细胞，并提及小鼠 Apoe 相关数据，说明数据可能涵盖人类细胞及小鼠模型两个层面的基因表达信息。研究关注胆固醇及基质体通路的失调，因此数据内容可能围绕这些通路的基因表达变化展开。除上述信息外，源站未提供更具体的数据内容描述，例如样本数量、测序平台、具体基因列表或分析结果等。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，项目编号为 786226。BioProject 记录本身不直接提供原始数据文件，而是提供指向该项目所产生各类数据的链接。源站描述指出，BioProject 是来自单一组织或联盟、与单一研究计划相关的生物数据集合。除来源站为 NCBI 及项目编号外，源站未提供该项目的具体采集方法、样本来源、实验设计或数据处理流程等细节。
【适用场景】
该数据集适用于与阿尔茨海默病、APOE ε4 遗传背景、神经胶质细胞生物学、胆固醇代谢及基质体通路相关的转录组或基因表达研究。研究人员可利用该 BioProject 记录查找该项目产生的数据，用于探索 APOE ε4 对人类小胶质细胞和星形胶质细胞基因表达的影响，或结合小鼠 Apoe 相关数据进行跨物种比较分析。此外，该数据集也可用于支持神经退行性疾病中脂质代谢与细胞外基质相关通路的研究。除上述基于标题和主题标签可合理关联的方向外，源站未提供具体的适用场景说明。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供，用户可通过项目编号 786226 在 NCBI BioProject 数据库中检索并访问。BioProject 记录提供统一入口，用于查找与该项目相关的多种数据类型及其链接。用户可根据记录中的链接进一步获取转录组或基因表达数据。除上述访问方式外，源站未提供具体的数据下载、处理或分析指南。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，其记录提供项目相关数据的链接入口。源站未提供关于数据质量、完整性、准确性或使用限制的具体说明。由于 BioProject 记录本身是数据集合的索引性描述，具体数据质量需依据其链接的原始数据文件及相应元数据判断。源站未提供相关质量评估信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式或使用许可信息。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 记录及其链接的原始数据页面中可能提供的引用要求和许可条款。源站未提供具体内容。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA786226
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
载脂蛋白E4（APOE4）是阿尔茨海默病（AD）最强的遗传风险因素，但其对人脑细胞功能的影响仍不清楚。在此，我们研究了APOE4对来源于人群和同基因型人类诱导多能干细胞模型、死后脑组织以及APOE靶向替换小鼠的脑细胞类型的影响。人群和同基因型模型揭示，APOE4局部单倍型而非单一风险等位基因单独促成风险。全局转录组分析揭示了星形胶质细胞和小胶质细胞中人类特异性的、APOE4驱动的脂质代谢失调。APOE4导致从头胆固醇合成升高，尽管星形胶质细胞中胆固醇的溶酶体隔离导致细胞内胆固醇积累。转录组分析揭示了与星形胶质细胞中趋化性、胶质激活和脂质生物合成上调相关的Matrisome失调，与神经元共培养再现了人脑中改变的星形胶质细胞matrisome信号传导。因此，APOE4引发胶质细胞特异性的细胞及非细胞自主性失调，这可能促成AD风险增加。
总体设计：我们对群体iPSC衍生、CRISPR编辑的同基因iPSC衍生的星形胶质细胞、小胶质细胞、混合皮层培养物、来自APOE 33与APOE 44的BMECs，以及来自APOE 33、APOE 44、Apoe WT和Apoe KO的小鼠星形胶质细胞和小胶质细胞进行了bulk RNA测序。本特定数据集为小鼠APOE33、APOE44、Apoe WT和Apoe KO。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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