女性大脑中年衰老过程中动态神经免疫图谱的出现:对阿尔茨海默病风险的意义 [P3]

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 675652),主题为女性大脑中年衰老过程中动态神经免疫图谱的出现及其对阿尔茨海默病风险的意义,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病方向

sra
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基因组预测Transcriptome or Gene expression
PRJNA675652: Emergence of Dynamic Neuro-Immune Profile During Mid-life Aging in the Female Brain: Implications for Alzheimer’s Disease Risk [P3]

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

女性大脑中年衰老过程中动态神经免疫图谱的出现:对阿尔茨海默病风险的意义 [P3]

该数据集为 NCBI BioProject 收录项目,编号 675652,英文标题为“Emergence of Dynamic Neuro-Immune Profile During Mid-life Aging in the Female Brain: Implications for Alzheimer’s Disease Risk [P3]”。其主题聚焦女性大脑中年衰老过程中动态神经免疫图谱的出现,以及这一变化对阿尔茨海默病风险的意义,归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向。数据主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明项目涉及转录组或基因表达层面的生物数据。该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于 BioProject 体系下的一个项目记录,为用户提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。整体而言,该数据集围绕女性大脑中年衰老与神经免疫动态变化展开,并与阿尔茨海默病风险关联,适合关注神经退行性疾病、衰老生物学及基因表达研究的人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集所属的 BioProject 体系,是围绕单一研究计划或由单一机构、联合体发起的一组生物数据的集合。BioProject 记录的作用,是为用户提供一个统一的位置,以便找到该项目所产生的多种数据类型。该数据集标题明确指出研究关注女性大脑中年衰老过程中动态神经免疫图谱的出现,并探讨其对阿尔茨海默病风险的影响。因此,其背景处于神经系统疾病与衰老研究的交叉领域,尤其与阿尔茨海默病风险因素相关。本站将其分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明项目数据与基因表达或转录组研究密切相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容涉及转录组或基因表达。源站描述指出,BioProject 记录提供用户单一入口,以查找为该项目生成的多样数据类型。因此,该数据集可能包含与女性大脑中年衰老、神经免疫动态变化及阿尔茨海默病风险相关的基因表达数据。除主题标签和标题所反映的方向外,源站未提供更具体的数据类型、样本数量、检测平台或分析结果等细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的项目记录,项目编号为 675652。源站描述说明,BioProject 可来自单一组织或联合体,并围绕单一研究计划收集生物数据。该数据集标题和短描述均指向女性大脑中年衰老过程中动态神经免疫图谱的研究,并与阿尔茨海默病风险相关。除来源站和项目编号外,源站未提供具体采集地点、采集时间、样本来源机构或实验设计等详细信息。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病、阿尔茨海默病、女性大脑衰老、神经免疫动态变化以及转录组或基因表达相关研究场景。研究人员可将其作为探索中年衰老过程中神经免疫图谱变化与阿尔茨海默病风险关联的数据资源。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,该数据集也可能用于基因表达分析、转录组数据挖掘或相关生物信息学研究。具体适用场景需结合源站提供的项目链接和数据类型进一步确认,源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录查找该项目所生成的多种数据类型链接。BioProject 记录本身提供统一入口,便于用户定位与项目相关的数据资源。使用时应依据源站提供的链接访问具体数据,并结合项目标题和主题标签理解数据背景。源站未提供具体下载方式、分析流程、软件工具或数据处理步骤,因此无法进一步说明详细使用方法。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共生物数据项目记录,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其标题和主题标签提供了研究方向和数据类型的概要信息。然而,源站未提供样本规模、数据完整性、质量控制指标、测序深度、统计方法或验证结果等质量相关信息。此外,源站未提供数据使用限制、伦理审批或访问权限等说明。因此,在质量与限制方面,只能确认其 BioProject 来源和主题标签,其他具体质量指标和限制条件均未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 675652。源站未提供具体引用格式、许可协议、使用条款或授权要求。用户如需引用或使用该数据集,应访问 NCBI BioProject 源站页面,查看该项目记录中可能提供的引用和许可信息。除来源站和项目编号外,源站未提供其他引用与许可相关内容。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA675652

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

衰老和内分泌过渡状态可显著影响各器官系统的炎症。神经炎症是阿尔茨海默病(AD)中已被充分记录的特征。在此,我们研究了女性大脑在中年衰老过程中出现的神经炎症,包括时间性和内分泌性衰老,作为驱动晚年AD风险的早期启动机制。分析在中年时间性和内分泌性衰老的转化啮齿动物模型中进行,随后在女性与年龄匹配男性的转录组图谱中加以验证。在转化模型中,女性中年衰老的神经炎症特征是内分泌和时间状态特异性的、动态的、解剖学上分布的且持续存在的。对衰老人海马体的微阵列数据集分析表明,神经炎症特征存在性别差异,女性表现出与我们在转化啮齿动物模型中发现模式相当的特征,而年龄匹配的男性则表现出与低神经免疫激活一致的特征。从转化角度看,这些发现对中年期进行治疗干预以降低晚发性AD风险具有重要意义。

总体设计:每组6只动物。雌性动物的年龄从6个月到16个月不等,处于不同的绝经状态。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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