基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA209800：阿尔茨海默病数据集

PRJNA209800: Alzheimer's Disease Dataset 对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA209800，主题为 Homo sapiens 的阿尔茨海默病相关数据。该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站将其归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议汇集生物数据的记录，这些数据来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其与转录组或基因表达相关。整体而言，该数据集面向人类阿尔茨海默病研究，提供与基因表达相关的生物项目数据入口。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA209800，源站标题为 Homo sapiens (ID 209800) - BioProject - NCBI。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议汇集生物数据的记录，这些数据来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本站将该数据集归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。源站未提供该项目的具体研究背景、发起机构或研究目的等进一步信息。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其涉及转录组或基因表达相关数据。数据集对应物种为 Homo sapiens，疾病主题为阿尔茨海默病。BioProject 记录本身提供指向该项目所产生的多种数据类型的链接，用户可通过该记录查找相关数据。源站未提供该数据集的具体样本数量、数据类型明细、基因列表、表达矩阵或其他具体数据内容。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA209800。BioProject 记录来自单一机构或联合体，用于汇集与单一研究计划或倡议相关的生物数据。源站未提供该项目的具体采集方法、样本来源、采集时间、采集地点或机构名称等信息。

【适用场景】

该数据集适用于与人类阿尔茨海默病相关的转录组或基因表达研究场景。用户可通过 BioProject 记录查找该项目所产生的多种数据类型，用于了解或获取与阿尔茨海默病相关的基因表达数据。源站未提供该数据集的具体适用场景、分析用途或推荐应用方向。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 编号 PRJNA209800 在 ncbi.nlm.nih.gov 上访问该记录，并借助 BioProject 记录提供的统一入口查找该项目所产生的多种数据类型。源站未提供该数据集的具体下载方式、数据格式、分析流程或使用步骤。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估、数据完整性、准确性、覆盖范围或具体限制等信息。BioProject 记录作为生物数据的汇集入口，提供指向多种数据类型的链接，但源站未提供该数据集的具体质量控制信息。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款等信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48350

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA209800

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自正常对照组（年龄20-99岁）和阿尔茨海默病病例的微阵列数据，涉及4个脑区：海马体、内嗅皮层、上额皮层、中央后回。分析了突触和免疫相关基因表达的变化，探究了年龄相关变化、AD相关变化以及区域特异性的变化模式。这些AD病例与GSE11882中包含的对照组病例（年轻和老年）同时处理（GSE11882数据集仅包含正常对照大脑的数据）。总体设计：死后脑组织从ADRC脑库收集。优先选择可获得3个或更多脑区的病例。标记为“indiv”的病例指正常对照组（年轻和老年），AD病例标记为“AD”。这些AD病例与GSE11882中包含的对照组病例（年轻和老年）同时处理（GSE11882数据集仅包含正常对照大脑的数据）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别