tau P301L转基因斑马鱼雌雄脑单核RNA测序
该数据集为BioProject ID 1365787，收录了tau P301L转基因斑马鱼雌性与雄性脑组织的单核RNA测序数据，主题标签为转录组或基因表达，本站归类于神经系统疾病与阿尔茨海默病
基本信息
资源简介
tau P301L转基因斑马鱼雌雄脑单核RNA测序
该数据集为 BioProject ID 1365787，英文名称为“Single-nucleus RNA sequencing of male and female brain in a tau P301L transgenic zebrafish”，收录了 tau P301L 转基因斑马鱼雌性与雄性脑组织的单核 RNA 测序数据。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站将其归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集而成的生物数据集合，通常由单一机构或联盟发起，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的核心价值在于以单核 RNA 测序手段，同时覆盖雌性与雄性 tau P301L 转基因斑马鱼的脑组织，为在转录组或基因表达层面研究该模型提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集所属的研究方向与神经系统疾病、阿尔茨海默病相关。其名称明确指向 tau P301L 转基因斑马鱼，并区分了雄性个体与雌性个体的脑组织。tau P301L 是名称中出现的转基因标识，表明该斑马鱼模型携带这一与 tau 蛋白相关的遗传改变。数据集以单核 RNA 测序为技术路径，聚焦脑组织，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。源站描述指出，BioProject 记录的作用是汇集与单一研究计划相关的生物数据，并提供链接以访问该项目产生的多种数据类型。因此，该数据集在背景上可被理解为一项围绕 tau P301L 转基因斑马鱼脑组织、兼顾雌雄两性的单核转录组研究项目。
【数据内容】
该数据集包含 tau P301L 转基因斑马鱼雌性与雄性脑组织的单核 RNA 测序数据。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明数据属于转录组或基因表达类型。数据集名称同时点明“male and female brain”，即雄性与雌性脑组织均被纳入。除上述信息外，关于样本数量、测序深度、细胞核数量、基因表达矩阵的具体形式、数据文件格式与体积等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，BioProject ID 为 1365787。源站标题显示为“Single-nucleus RNA sequencing of male and female b... (ID 1365787) - BioProject - NCBI”。源站描述说明，BioProject 是来自单一机构或联盟、与单一研究计划相关的生物数据集合，并为用户提供查找该项目多种数据类型的统一入口。除上述来源信息外，关于具体研究机构、作者、样本采集地点、伦理审批信息及项目资助来源等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕 tau P301L 转基因斑马鱼脑组织的单核 RNA 测序分析。由于数据同时覆盖雌性与雄性个体，可用于在基因表达层面考察该模型脑组织中的性别差异。结合本站分类，其适用方向包括神经系统疾病与阿尔茨海默病相关研究。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明，该数据可用于基因表达分析、转录组层面的比较研究，以及围绕该转基因模型脑组织的单核水平表达特征探索。除上述方向外，具体分析目标与应用场景需依据源站记录进一步确认，源站未提供更细化的适用说明。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 BioProject ID 1365787 在 ncbi.nlm.nih.gov 上定位该项目，并借助 BioProject 记录所提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供单一入口，以便找到与同一研究计划相关的不同数据类型。因此，使用该数据集时，应以该 BioProject 记录为起点，访问其关联的数据资源。关于具体下载方式、数据处理流程、分析工具与参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，其名称与描述指向 tau P301L 转基因斑马鱼雌性与雄性脑组织的单核 RNA 测序。关于数据质量指标、测序质量、细胞核捕获效率、批次效应、重复数、统计效力及潜在偏差等，源站未提供。该数据集仅覆盖脑组织，且仅涉及 tau P301L 转基因斑马鱼这一模型，其结论外推至其他物种、其他组织或其他疾病模型时需谨慎。除上述内容外，源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，BioProject ID 为 1365787。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制与再分发条件等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1365787
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
微管相关蛋白tau在阿尔茨海默病及相关tau蛋白病中形成病理性聚集体，动物模型被广泛用于剖析所涉及的细胞过程。表达人类突变tau的转基因斑马鱼提供了一种脊椎动物系统，可在其中检查神经元tau病理，然而此类模型的单细胞分辨率转录组资源仍然稀缺。在此，我们描述了一个单核RNA测序数据集，该数据集来自六个月龄转基因斑马鱼的整脑组织，这些斑马鱼在神经元特异性启动子下表达携带P301L突变的人类tau，并同时包含野生型对照。两种性别均被分析，每种性别和基因型有两个重复文库，总共八个文库。细胞核从混合脑组织中分离，采用基于液滴的3′检测进行处理，并测序以生成跨主要脑细胞类型的全转录组表达谱。我们提供原始测序读段、处理后的基因×细胞核计数矩阵以及细胞类型注释。
该资源可重复用于研究该模型的细胞类型特异性和性别分辨的转录特征，并支持与哺乳动物数据集的比较分析。总体设计：我们使用了Tg(TauP301L-dsRed)转基因斑马鱼品系，该品系在HuC/D启动子控制下表达人突变tau（P301L），确保神经元特异性表达。该模型再现了人tau蛋白病的关键特征，包括tau过度磷酸化、神经原纤维缠结形成和进行性神经退行性变。野生型AB斑马鱼作为对照。我们为每种条件（转基因和野生型对照）使用了两个生物学重复，每个生物学重复有两个技术重复。所有斑马鱼操作均根据卢森堡大公国法令（2016年1月20日和2023年1月26日）的授权进行，并遵守欧洲法规（指令2010/63/EU）。野生型AB和Tg(TauP301L-dsRed)斑马
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
