PRJNA1097599：阿尔茨海默病新皮质第4层神经元韧性分子特征
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1097599），主题为阿尔茨海默病新皮质第 4 层神经元韧性分子特征，属于神经系统疾病／阿尔茨海默病方向
基本信息
资源简介
PRJNA1097599：阿尔茨海默病新皮质第4层神经元韧性分子特征
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号 1097599，英文名称为 PRJNA1097599: Molecular Signatures of Resilience to Alzheimer’s Disease in Neocortical Layer 4 Neurons。其主题聚焦于阿尔茨海默病新皮质第 4 层神经元韧性相关的分子特征，属于神经系统疾病／阿尔茨海默病研究方向。从主题标签看，该项目的核心数据类型为转录组或基因表达。BioProject 作为生物数据集合，通常围绕单一研究计划组织，来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以链接该项目所产生的多种数据类型。该数据集适合关注阿尔茨海默病神经生物学机制、神经元韧性以及新皮质特定层神经元分子变化的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 1097599。其标题指向阿尔茨海默病新皮质第 4 层神经元韧性分子特征的研究方向。BioProject 的定位是围绕单一研究计划汇集生物数据，这些数据可来自单一组织或联合体。BioProject 记录本身为用户提供一个集中位置，用于查找与该项目相关的多种数据类型。因此，该数据集在背景上属于以项目为单位组织的生物数据资源，主题落在神经系统疾病中的阿尔茨海默病方向，并特别涉及新皮质第 4 层神经元与韧性相关的分子特征。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。项目名称强调“分子特征”与“韧性”，研究对象指向阿尔茨海默病背景下的新皮质第 4 层神经元。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表、分析结果或原始数据文件等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，具体为 NCBI BioProject 数据库中的项目记录，编号 1097599。BioProject 记录通常用于汇集与单一研究计划相关的生物数据，并链接该项目产生的多种数据类型。关于样本采集地点、供体信息、伦理审批、实验设计、建库方法或测序策略等具体采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经系统疾病／阿尔茨海默病方向的研究场景，尤其是关注新皮质第 4 层神经元韧性分子特征、转录组或基因表达分析的研究。它可作为查找相关项目数据类型的入口，帮助研究者定位与阿尔茨海默病神经元韧性相关的生物数据。关于该数据集是否适用于特定分析流程、能否用于诊断、治疗或生物标志物开发等具体应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 记录访问，项目编号为 1097599。BioProject 记录提供用户查找与该项目相关的多种数据类型的集中入口。关于具体下载方式、数据格式、分析工具、参数设置或复现步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 项目记录，其描述强调 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，并提供链接多种数据类型的入口。关于数据质量、完整性、批次效应、样本量、统计效力、技术偏差或使用限制等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1097599。关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策等具体信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1097599
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
单细胞组学正在推进我们对阿尔茨海默病（AD）中选择性神经元易损性的理解，揭示了对神经退行性变易感或具有韧性的特定亚型。利用单核和空间转录组学比较AD中早期受累（前额叶皮层和楔前叶）或晚期受累（初级视觉皮层）的新皮层区域，我们在初级视觉皮层第4层鉴定出一个具有韧性的兴奋性群体，表达RORB、CUX2和EYA4。联合新皮层第4层神经元共享重叠的韧性分子特征。在疾病早期，韧性神经元上调与突触维持、突触可塑性、钙稳态和神经保护因子相关的基因，包括GRIN2A、RORA、NRXN1、NLGN1、NCAM2、FGF14、NRG3、NEGR1和CSMD1。我们还鉴定出KCNIP4——编码一种电压门控钾（Kv）通道相互作用蛋白，可与Kv4.2通道及早老素相互作用——是与韧性相关的关键因子。KCNIP4在病理早期阶段持续上调。
此外，在人源化AD小鼠模型中，AAV介导的Kcnip4过表达降低了活动依赖性基因Arc和c-Fos的表达，提示存在对抗神经元过度兴奋的代偿机制。我们的数据集为研究神经退行性变的抵抗机制提供了宝贵资源。总体设计：该单核RNAseq数据集来源于因阿尔茨海默病（AD）去世的患者及年龄匹配的健康对照者的死后新鲜冷冻人脑皮质。它包含约500,000个细胞核，其中约80%为神经元，来自46位供体的前额叶（BA9）、楔前叶（BA7）和初级视觉（BA17）皮质，包括18位无或低AD病理（Braak 0-II）、10位中度AD病理（Braak III-IV）和18位高度AD病理（Braak V-VI）的供体。样本按照我们在h中描述的方案进行处理。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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