小鼠脑内注射淀粉样蛋白寡聚体后的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB39935

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目旨在探究由淀粉样蛋白β（Abeta）寡聚体诱导的小鼠脑内分子和细胞反应，这些寡聚体与阿尔茨海默病的发病机制有关。本研究中，从富含斑块的APP转基因小鼠大脑中分离出可溶性高分子量Abeta种类（>200 kDa），并将其注射到年轻APP转基因小鼠的海马或小脑延髓池。在注射后不同时间点（1个月和3个月）收集半脑样本进行批量RNA测序，以捕捉与Abeta诱导的β-淀粉样变性和反应性胶质增生相关的转录组变化。该数据集为理解Abeta病理传播早期阶段神经元和胶质细胞中的基因表达改变提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。