单细胞分辨率下人群规模人前额叶皮层跨疾病图谱

该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,包含冷冻人脑前额叶皮层的基因型与单核转录组数据,覆盖 1,494 名供体、超过 630 万个细胞核,涉及阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍、弥漫性路易体痴呆及神经典型对照等多种神经退行性与严重精神疾病

cellxgene
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基因组分类Lewy body dementiaParkinson diseaseamyotrophic lateral sclerosisargyrophilic grain diseaseatherosclerosisbipolar I disorderbipolar I disorder || anorexia nervosabipolar I disorder || atherosclerosisbipolar I disorder || brain neoplasmbipolar I disorder || bulimia nervosabipolar II disorderbipolar disorder
Population-scale cross-disorder atlas of the human prefrontal cortex at single-cell resolution

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

单细胞分辨率下人群规模人前额叶皮层跨疾病图谱

该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,包含冷冻人脑前额叶皮层的基因型与单核转录组数据,覆盖 1,494 名供体、超过 630 万个细胞核,涉及阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍、弥漫性路易体痴呆及神经典型对照等多种神经退行性与严重精神疾病。48% 供体有神经精神症状,超过 21% 获得多重诊断。可用于跨疾病共享机制研究、疾病分类与治疗靶点探索(来源 cellxgene.cziscience.com)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):神经退行性疾病和严重精神疾病常表现出重叠特征,凸显了共享潜在机制的可能性。为促进对这些疾病的更深入理解并为更有效的治疗铺平道路,我们生成了一个群体规模的多组学数据集,由来自冷冻人脑标本前额叶皮层的基因型和单核转录组数据组成。我们的数据集涵盖来自 1,494 名供体的超过 630 万个细胞核,代表了多种神经退行性疾病和严重精神疾病,包括阿尔茨海默病和帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和弥漫性路易体痴呆,以及神经典型对照。值得注意的是,所有供体中有 48% 表现出神经精神症状,而超过 21% 接受了多重诊断。该数据集为投入研究提供了前所未有的机会

【主题与分类】

主题标签:Lewy body dementia、Parkinson disease、amyotrophic lateral sclerosis、argyrophilic grain disease、atherosclerosis、bipolar I disorder、bipolar I disorder || anorexia nervosa、bipolar I disorder || atherosclerosis、bipolar I disorder || brain neoplasm、bipolar I disorder || bulimia nervosa。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/84ce6837-548d-4a1f-919f-0bc0d9a3952f

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

神经退行性疾病与严重精神疾病常表现出重叠特征,凸显了其潜在共享机制的可能性。为促进对这些疾病的深入理解并为更有效的治疗铺平道路,我们构建了一个群体规模的多组学数据集,包含来自冷冻人脑标本前额叶皮层的基因型和单核转录组数据。我们的数据集涵盖来自1,494名供体的超过630万个细胞核,代表了多种神经退行性疾病和严重精神疾病,包括阿尔茨海默病和帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和弥漫性路易体痴呆,以及神经正常对照。值得注意的是,48%的供体表现出神经精神症状,而超过21%的供体接受了多种诊断。该数据集为研究跨越一系列脑相关疾病的共同和独特分子通路提供了前所未有的机会。我们进行了严格的预处理和质量控制,确保了数据的可靠性和可用性。

为促进合作研究,我们将这一宝贵资源作为在线存储库提供,以便科学界广泛开展分析。疾病:路易体痴呆、帕金森病、肌萎缩侧索硬化、嗜银颗粒病、动脉粥样硬化、动脉粥样硬化 || 迟发性运动障碍 || 分裂情感性双相障碍、双相I型障碍、双相I型障碍 || 神经性厌食症。组织:背外侧前额叶皮层。检测:10x 3’ v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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