AD tauopathy模型单细胞与空间转录组揭示细胞间信号传导与突触解构

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305314

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病（AD）是全球老年人痴呆症的首要病因；然而，导致其发病和进展的所有机制尚未被完全阐明。在此，我们报告了对一种模拟人类tau蛋白病的转基因大鼠模型大脑进行的单细胞多组学和空间转录组学分析。在这一先进的转基因模型中，我们识别出了tau驱动的AD病理的新标志物，并为先前已知的AD相关基因提供了单细胞层面的证据。我们的研究结果揭示了tau病理性过度磷酸化和衰老如何改变配体-受体通讯、转录因子调控网络以及特定的细胞网络。值得注意的是，我们发现由于tau蛋白病，涉及谷氨酸能传递和netrin信号传导的细胞通讯发生了引人关注的变化。总体而言，本研究强化了突触功能障碍作为AD标志性特征的概念，并突出了未来机制研究或新型治疗策略的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。