β-羟基丁酸诱导星形胶质细胞谷氨酸摄取及转运体表达上调
研究对星形胶质细胞进行 BHB 处理后的转录组测序,鉴定差异表达基因,发现编码谷氨酸转运体 EAAT1 的 slc1a3 显著上调

基本信息
资源简介
β-羟基丁酸诱导星形胶质细胞谷氨酸摄取及转运体表达上调
β-hydroxybutyrate Induces upregulation of Glutamate Uptake and Transporter Expression in Astrocytes
该数据集来自 NCBI GEO(GSE240771),包含 1 个文件 GSE240771_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱分析。研究对星形胶质细胞进行 BHB 处理后的转录组测序,鉴定差异表达基因,发现编码谷氨酸转运体 EAAT1 的 slc1a3 显著上调。数据可用于分析 BHB 对星形胶质细胞基因表达的影响,并探索其神经保护机制与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)的关联(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 14 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):酮体 β-羟基丁酸(BHB)已被报道具有神经保护功能,是治疗帕金森病和阿尔茨海默病等神经退行性疾病的有前景的方法。星形胶质细胞是中枢神经系统中最丰富的胶质细胞,已被证明在神经退行性疾病的发生和进展中发挥关键作用。已知 BHB 可改变神经元代谢和功能,但其对星形胶质细胞的影响知之甚少。在此,我们进行了转录组测序分析,以检查 BHB 在星形胶质细胞中诱导的差异表达基因,并鉴定出编码谷氨酸转运体 EAAT1 的 slc1a3 在 BHB 处理中显著上调。我们的发现提示了 BHB 神经保护作用的新机制,并强化了 BHB 对中枢神经系统的有益作用
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL18694、10116。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240771
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 01 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
酮体β-羟基丁酸(BHB)已被报道具有神经保护功能,是治疗帕金森病和阿尔茨海默病等神经退行性疾病的有前景的方法。星形胶质细胞是中枢神经系统中最丰富的胶质细胞,已被证明在神经退行性疾病的发生和进展中发挥关键作用。已知BHB可改变神经元代谢和功能,但其对星形胶质细胞的影响尚不清楚。在此,我们进行了转录组测序分析,以检查BHB在星形胶质细胞中诱导的差异表达基因,并发现编码谷氨酸转运体EAAT1的slc1a3在BHB处理中显著上调。我们的发现提出了BHB神经保护作用的新机制,并强化了BHB对中枢神经系统(CNS)的有益作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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