散发性帕金森病与阿尔茨海默病中蛋白聚集致病性再审视数据
该数据集来自 Dryad,对应 2019 年发表的一项关于散发性帕金森病与阿尔茨海默病中蛋白聚集是否具有致病性的研究。源站描述指出,帕金森病确诊的金标准是 alpha-synuclein 聚集形成 Lewy 小体,阿尔茨海默病则是 amyloid 聚集形成斑块、过度磷酸化 tau 形成缠结;这些聚集

基本信息
资源简介
散发性帕金森病与阿尔茨海默病中蛋白聚集致病性再审视数据
Data from: Revisiting protein aggregation as pathogenic in sporadic Parkinson’s and Alzheimer’s diseases
该数据集来自 Dryad,对应 2019 年发表的一项关于散发性帕金森病与阿尔茨海默病中蛋白聚集是否具有致病性的研究。源站描述指出,帕金森病确诊的金标准是 alpha-synuclein 聚集形成 Lewy 小体,阿尔茨海默病则是 amyloid 聚集形成斑块、过度磷酸化 tau 形成缠结;这些聚集在散发性病例尸检中近乎普遍,可能代表上游机制的共同结局或细胞应激的代偿反应,而非疾病起点的致病因素。数据可用于探讨蛋白聚集的致病性、疾病修饰治疗与临床试验相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2019。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):帕金森病(PD)确诊的金标准是病理学发现 alpha-synuclein 聚集形成 Lewy 小体,阿尔茨海默病(AD)则是 amyloid 聚集形成斑块、过度磷酸化 tau 形成缠结。这种基于临床-病理学的疾病分类学隐含一个假设:尸检时的病理性蛋白聚集反映了疾病起病时的发病机制。虽然这些聚集在特殊情况下可能处于人类致病通路之上(例如 SNCA 基因倍增中的聚集 alpha-synuclein 或 APP 突变中的聚集 amyloid),但它们在散发性 PD 和 AD 尸检中近乎普遍存在,提示它们也可能代表上游机制的共同结局或为延迟细胞死亡而对细胞应激作出的代偿反应。这三种蛋白聚集的概念框架(致病性、副现象、p
【主题与分类】
主题标签:disease modifying treatments、Alzheimer’s disease、Clinical trials、Parkinson’s disease。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.g1nq02r
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.g1nq02r
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 81.4 KB。
数据说明
帕金森病(PD)确诊的金标准是病理学发现α-突触核蛋白聚集形成路易小体,而阿尔茨海默病(AD)的金标准则是淀粉样蛋白聚集形成斑块以及过度磷酸化的tau蛋白形成神经原纤维缠结。这种基于临床-病理学的疾病分类学隐含着一个假设:尸检时发现的病理性蛋白聚集反映了疾病发病时的发病机制。尽管这些聚集物在特殊情况下可能处于人类的致病通路上(例如,SNCA基因倍增中的α-突触核蛋白聚集或APP突变中的淀粉样蛋白聚集),但它们在散发性PD和AD尸检中几乎普遍存在,这表明它们也可能代表上游机制的共同结局,或是对细胞应激的代偿性反应以延缓细胞死亡。蛋白质聚集的这三种概念框架(致病性、附带现象、保护性)难以厘清,因为无法实时探查脑组织。动物模型(PD和AD在自然状态下均不发生)一致支持蛋白质聚集的致病作用,而来自人类研究的间接证据则不支持这一观点。
我们假设:(1) 当前的蛋白质聚集体生物标志物可能与常见病理相关,但与亚组发病机制无关;(2) 针对寡聚体或纤维的疾病修饰治疗可能无效甚至有害,因为这些蛋白质在分子应激下的人脑中可能是副现象或具有保护作用。未来针对神经退行性疾病的分子靶向精准医学工作,可能需要不局限于当前临床病理标准的分析,而应基于来自大型深度表型化衰老人群或规模较小但定义明确的遗传-分子队列所产生的生物信号。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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