外阴鳞状细胞癌表达谱数据集
包含外阴鳞状细胞癌与正常外阴组织的基因表达芯片数据,用于肿瘤相关基因筛选和差异表达分析。由Oslo University Hospital提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含18条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的外阴癌研究。

基本信息
资源简介
外阴鳞状细胞癌表达谱数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Expression analysis of 13 squamous cell carcinomas arising in the vulva》。源站首次发布:May 24 201。
【数据内容】
源站原始描述:The genome of 14 vulvar SCC was analyzed by aCGH and microarray to identify common imbalances present in the tumors as well as which genes were deregulated. Overall there was a good concordance between the imbalances scored by aCGH and the level of gene expression found by microarray, i.e., the genes located in gained regions were overexpressed while those located in lost regions were found down-regulated
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE38228
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE38228
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.05 GB。
数据说明
包含外阴鳞状细胞癌与正常外阴组织的基因表达芯片数据,用于肿瘤相关基因筛选和差异表达分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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