侵袭性外阴鳞状细胞癌RNA测序数据集
包含23例侵袭性外阴鳞状细胞癌FFPE组织RNA-seq数据，并标注HPV状态，适合转录组分型和差异表达分析。由UT Southwestern Medical Center提供，来自Gene Expression Omnibus，数据格式为表格，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的外阴癌研究。
基本信息
资源简介
侵袭性外阴鳞状细胞癌RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNA sequencing of invasive vulvar squamous cell carcinoma (VSCC)》。源站首次发布：Sep 05 202。
【数据内容】
源站原始描述：We retrospectively identified cases of invasive vulvar squamous cell carcinoma. Formalin fixed, paraffin embedded tissues samples were retrieved. Sections were confirmed by H&E staining prior to analysis. Sections were processed by ribosomal RNA depletion and RNA-sequencing (KAPA RNA HyperPrep with RiboErase) (HMR). 23 patient samples had RNA of sufficient quality for analysis. HPV status was determined by a consensus of high-risk HPV RNA-ISH and HPV DNA PCR. Only samples that were positive in b…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE183454
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 02 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE183454
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含23例侵袭性外阴鳞状细胞癌FFPE组织RNA-seq数据，并标注HPV状态，适合转录组分型和差异表达分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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