软组织肉瘤微环境及基因组突变谱数据集
专注于高级别软组织肉瘤（尤其是UPS）的转录组学数据集。由NCBI GEO提供，来自Gene Expression Omnibus，数据格式为文本，包含98条数据记录，适用于分类任务，许可证为Open Data Commons。
基本信息
资源简介
软组织肉瘤微环境及基因组突变谱数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Deep sequencing and automated histochemistry of human tissue slice cultures improve their usability as preclinical model for cancer research》。源站首次发布：Aug 27 201。
【数据内容】
源站原始描述：Cancer research requires models closely resembling the tumor in the patient. Human tissue cultures can overcome interspecies limitations of animal models or the loss of tissue architecture in in vitro models. However, analysis of tissue slices is often limited to histology. Here, we demonstrate that slices are also suitable for whole transcriptome sequencing and present a method for automated histochemistry of whole slices
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL16791、9606。
【适用方向】
文本类数据可用于医学自然语言处理，如命名实体识别、信息抽取与文本分类。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119102
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 04 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119102
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.85 GB。
数据说明
专注于高级别软组织肉瘤（尤其是UPS）的转录组学数据集。包含高通量全基因组RNA测序矩阵，用于挖掘未分化多形性肉瘤侵袭性相关的靶向通路及免疫屏障特征。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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