未处理2102Ep细胞的H3K4me3与YY1 ChIP-seq
该数据集为未处理2102Ep细胞的H3K4me3与YY1 ChIP-seq数据，来源于omicsdi.org，属于肿瘤/睾丸癌分类
基本信息
资源简介
未处理2102Ep细胞的H3K4me3与YY1 ChIP-seq
该数据集为未处理2102Ep细胞的H3K4me3与YY1 ChIP-seq数据，来源于omicsdi.org，属于肿瘤/睾丸癌分类。源站描述显示，研究者用bs-ATLAS-seq全面定位并评估2102Ep细胞基因组中人类全长LINE-1元件（L1）的DNA甲基化状态（E-MTAB-10895），并对部分位点进行靶向纳米孔测序检测DNA甲基化（E-MTAB-12247）；为研究L1 DNA甲基化与表达的联系，还在同一细胞系中完成RNA-seq（E-MTAB-12246）以及YY1和H3K4me3 ChIP-seq（即本数据集）。该数据可用于研究L1甲基化、YY1结合与H3K4me3修饰之间的关系（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们使用bs-ATLAS-seq全面定位并评估2102Ep细胞基因组中人类全长LINE-1元件（L1）的基因组位置和DNA甲基化状态（E-MTAB-10895）。我们还实现了靶向纳米孔测序，以检测一部分位点上的DNA甲基化（E-MTAB-12247）。为了进一步研究L1 DNA甲基化与表达之间的联系，我们在同一细胞系中进行了RNA-seq（E-MTAB-12246），以及YY1和H3K4me3 ChIP-seq（本数据集）。
【主题与分类】
主题标签：Genomics。本站分类：肿瘤/睾丸癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12249
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12249
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用bs-ATLAS-seq全面绘制了2102Ep细胞基因组中人类全长LINE-1元件（L1）的基因组位置，并评估了其DNA甲基化状态（E-MTAB-10895）。我们还实现了靶向纳米孔测序，以检测部分位点上的DNA甲基化情况（E-MTAB-12247）。为进一步探究L1 DNA甲基化与表达之间的联系，我们在同一细胞系中进行了RNA-seq（E-MTAB-12246），以及YY1和H3K4me3 ChIP-seq（本数据集）。
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