滑膜肉瘤单细胞门户数据集SCP167
SCP167 是 Broad Single Cell Portal 上的滑膜肉瘤单细胞RNA数据集，包含临床肿瘤样本细胞表达矩阵。由Broad Institute of MIT and Harvard提供，数据格式为表格，包含6975条数据记录，适用于分类任务。
基本信息
资源简介
滑膜肉瘤单细胞门户数据集SCP167
【一句话概览】
滑膜肉瘤的发生与演化机制尚未完全阐明。研究对12例临床肿瘤样本进行单细胞RNA测序，以识别瘤内与瘤间异质性的决定因素。肿瘤中存在一群恶性细胞亚群，表达以氧化代谢和免疫逃逸为核心的致癌程序，该程序可预测转移性疾病和不良临床结局，并受滑膜肉瘤遗传驱动因素正向调控、受肿瘤微环境细胞因子抑制。依据该程序特征，联合使用HDAC与CDK4/6抑制剂可阻断该程序，选择性靶向滑膜肉瘤细胞而不损伤非恶性细胞，提示一种新的联合治疗策略（来源 singlecell.broadinstitute.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Synovial sarcoma》。
【数据内容】
源站原始描述：The genetic, epigenetic and microenvironmental cues that shape the development and evolution of synovial sarcoma are only partly understood. Here, we leverage single cell RNA-Seq of 12 clinical tumor samples to identify the determinants of intra- and inter-tumor heterogeneity in synovial sarcoma. Tumors contain a subpopulation of malignant cells expressing a core oncogenic program of oxidative metabolism and immune evasion, which is predictive of metastatic disease and poor clinical outcomes. Th…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：塑造滑膜肉瘤发生与演变的遗传、表观遗传及微环境因素目前仅被部分了解。本研究利用12例临床肿瘤样本的单细胞RNA测序，旨在揭示滑膜肉瘤瘤内及瘤间异质性的决定因素。肿瘤中包含一个恶性细胞亚群，该亚群表达以氧化代谢和免疫逃逸为核心致癌程序，这一特征可预测转移性疾病及不良临床结局。该程序受滑膜肉瘤遗传驱动因素正向调控，并被肿瘤微环境细胞因子所抑制。基于该程序的特征预测，我们通过联合HDAC和CDK4/6抑制剂阻断此程序，选择性靶向滑膜肉瘤细胞，同时避免影响非恶性细胞。本研究揭示了未被充分认识的侵袭性决定因素，并提出了一种新的联合治疗策略。
【主题与分类】
主题标签：synovial sarcoma、single cell RNA-Seq、tumor microenvironment、intra-tumor heterogeneity、inter-tumor heterogeneity、oxidative metabolism、immune evasion、metastasis、HDAC inhibitor、CDK4/6 inhibitor。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell/study/SCP167/synovial-sarcoma
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell/study/SCP167/synovial-sarcoma
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
SCP167 是 Broad Single Cell Portal 上的滑膜肉瘤单细胞RNA数据集，包含临床肿瘤样本细胞表达矩阵。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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