反流性疾病中胃部细菌组成数据集

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03835663

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：胃食管反流病、食管癌、食管反流、胃癌、胃食管反流、食管癌、巴雷特食管、食管炎。胃和食管（OG）癌与不良的长期预后相关，总体而言，由于疾病发现较晚，不到25%的患者生存超过5年。越来越多的证据表明，细菌在OG癌和胃食管反流病（GORD）的发生发展中起重要作用。约十分之一的人患有GORD，这是导致胃癌和食管癌最常见的疾病之一。在GORD中，手术治疗是预防癌症最成功的方法，但约85%的患者术后出现并发症。抑酸药物可降低食管癌风险，但同样会增加胃癌风险。它们还会缩短患者的预期寿命，且往往无法缓解症状。对GORD患者粪便样本的分析表明，其肠道细菌组成与正常人不同，反而与癌症患者中发现的组成相似。显然需要改善OG癌的预后。

这可以通过识别胃组织、胃内容物和唾液中导致癌症发展的细菌，并有可能消除它们，从而避免癌症的发生来实现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。