ST003953:ESRP1基因敲除后胃癌代谢组学分析
该研究采用液相色谱-质谱(LC-MS)技术,研究物种为人(Homo sapiens),由复旦大学附属肿瘤医院完成,数据发布于代谢组学工作站的公开平台

基本信息
资源简介
ST003953:ESRP1基因敲除后胃癌代谢组学分析
ST003953 是一项以代谢组学为方法的研究数据,题为“Metabolomic Profiling of Gastric Cancer Post-ESRP1 Gene Knockout”,即对 ESRP1 基因敲除之后的胃癌所进行的代谢谱分析。该研究采用液相色谱-质谱(LC-MS)技术,研究物种为人(Homo sapiens),由复旦大学附属肿瘤医院完成,数据发布于代谢组学工作站的公开平台。
【数据集背景】
从归属方向来看,该数据集被划入肿瘤领域下的胃癌方向,说明其研究语境与胃部恶性肿瘤相关。数据集名称中的“Post-ESRP1 Gene Knockout”提示,研究的核心变量是 ESRP1 基因被敲除之后的状态,即围绕该基因缺失条件下样本的代谢特征展开观察。研究机构为复旦大学附属肿瘤医院(Fudan University Shanghai Cancer Center)。除上述信息外,关于研究的设计动机、所依据的生物学假设、实验分组方案、是否设置对照以及样本的具体来源,源站未提供。
【数据内容】
按照源站的介绍,这是一项代谢组学研究,检测手段为 LC-MS,与之关联的技术关键词同样为 LC-MS。也就是说,数据的主体应当是液相色谱-质谱联用所获得的代谢物相关信息。至于实际检出的代谢物种类与数量、定性鉴定的结果、定量或半定量的数值表、原始谱图文件、峰表以及经过处理的数据文件等具体内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站点为 metabolomicsworkbench.org,属于代谢组学领域的公开数据发布渠道之一。研究涉及的生物物种为人(Homo sapiens),承担单位是复旦大学附属肿瘤医院,所采用的检测平台为 LC-MS。关于样本的类型(例如组织、细胞或体液)、样本采集与保存流程、样本数量与生物学重复设置、色谱分离条件、质谱仪器型号、扫描模式以及数据采集时间等细节,源站未提供。
【适用场景】
作为一项与胃癌相关的 LC-MS 代谢组学研究,该数据集在一般意义上可被用于代谢组学数据的检索、浏览与再利用等方向。在代谢组学研究中,此类数据常见的通用用途包括代谢物鉴定、代谢通路层面的比较分析以及不同实验条件之间代谢特征的对照等。但就本数据集而言,它是否支持上述某一类具体分析、适合与哪些数据联合使用,源站未提供相应说明,无法据此作出判断。
【使用方法】
关于数据的获取方式、下载入口、文件组织格式、配套的元数据说明、数据处理与统计分析流程等,源站未提供。因此,如何在具体研究工作中调用和解析该数据集,源站未提供。
【质量与限制】
关于数据的质量控制指标、缺失值比例、批次效应评估、重复性验证结果以及研究本身的局限性说明,源站未提供。使用者若计划使用该数据,需自行向来源站点核实相关质量信息。
【引用与许可】
该数据集对应的文献出处、推荐引用格式、作者署名方式以及使用许可条款,源站未提供。在正式引用或二次使用前,建议以来源站点的原始记录为准进行确认。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST003953
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
代谢组学研究(LC-MS)。物种:Homo sapiens。机构:Fudan University Shanghai Cancer Center。
数据缺失?
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