与癌症恶病质相关的肌肉、肝脏和血液样本的蛋白质组分析
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦肿瘤领域的胃癌方向,主题标签为 Proteomics。数据覆盖多种小鼠癌症恶病质模型以及人类胃癌患者的样本,通过定量蛋白质组学和蛋白质酰化谱分析获得

基本信息
资源简介
与癌症恶病质相关的肌肉、肝脏和血液样本的蛋白质组分析
该数据集名为 Proteome analysis of muscle, liver, and blood samples associated with cancer cachexia,来源于 omicsdi.org,在肿瘤领域中被归入胃癌方向,主题标签为 Proteomics。数据集围绕癌症恶病质这一与肿瘤进展密切相关的全身性代谢紊乱状态展开,采集了多种小鼠癌症恶病质模型以及人类胃癌患者的样本,并借助定量蛋白质组学和蛋白质酰化谱分析技术对肌肉、肝脏和血液样本进行系统检测。通过跨物种、多组织的蛋白质组与酰化修饰联合分析,该数据集旨在从蛋白质表达丰度与翻译后修饰两个层面刻画癌症恶病质状态下机体分子层面的变化特征,为理解肿瘤导致的肌肉消耗、肝功能代谢重编程以及循环系统相关蛋白改变提供数据基础。
【数据集背景】
癌症恶病质是肿瘤患者常见的并发症之一,常表现为体重下降、骨骼肌萎缩、脂肪分解以及全身炎症和代谢紊乱,严重影响患者生活质量和治疗耐受性。胃癌作为消化系统常见恶性肿瘤,其患者中恶病质发生率较高,因此成为研究该综合征的重要临床场景。该数据集正是在这一背景下产生,试图通过多模型、多组织、多组学层次的蛋白质分析,捕捉癌症恶病质在肌肉、肝脏和血液中的分子表现。源站描述指出,研究同时覆盖小鼠癌症恶病质模型与人类胃癌患者样本,说明其设计兼顾了模式动物的可控性与临床样本的真实性,为后续比较分析和转化研究提供基础。
【数据内容】
数据集的核心内容为定量蛋白质组学数据和蛋白质酰化谱数据。样本类型包括肌肉、肝脏和血液三类组织或体液,来源涵盖多种小鼠癌症恶病质模型以及人类胃癌患者。定量蛋白质组学用于衡量蛋白质在不同样本中的表达水平变化,蛋白质酰化谱分析则关注蛋白质酰化修饰状态。通过这两类数据的结合,可以同时观察蛋白质丰度变化与修饰层面的改变。主题标签 Proteomics 表明该数据集以蛋白质组学为主要技术框架。除上述信息外,源站未提供更具体的蛋白数量、修饰位点数量、样本例数或分组细节。
【采集与来源】
数据集的来源站为 omicsdi.org,该平台用于汇集和索引多组学数据集。源站描述明确说明,研究通过定量蛋白质组学和蛋白质酰化谱分析对样本进行检测,样本来自多种小鼠癌症恶病质模型和人类胃癌患者。数据集在分类上属于肿瘤领域下的胃癌方向。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、小鼠模型的具体构建方式以及患者临床信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于癌症恶病质相关的蛋白质组学与翻译后修饰研究,尤其是围绕胃癌背景下的肌肉萎缩、肝脏代谢改变和血液标志物探索。研究人员可利用该数据比较不同小鼠恶病质模型之间以及模型与人类胃癌患者之间的蛋白质表达和酰化修饰差异,寻找潜在分子标志物或机制线索。此外,该数据集也可用于蛋白质组学方法学参考、多组织联合分析以及跨物种比较研究。由于涉及肌肉、肝脏和血液三类样本,其适用方向还包括组织间通讯和系统性代谢紊乱的分子特征分析。具体应用需结合源站提供的原始数据与元数据。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取或检索。使用者应根据源站提供的数据访问方式下载或链接至原始数据资源。由于源站未提供详细的文件格式、数据处理流程、归一化方法或分析工具建议,使用前需参考源站附带的说明文档。对于定量蛋白质组学和蛋白质酰化谱数据,通常需要依据原始数据中的定量矩阵、注释信息和样本分组进行再分析。若需跨物种比较,应注意物种间蛋白注释差异。源站未提供具体分析步骤和推荐软件。
【质量与限制】
该数据集整合了多种小鼠癌症恶病质模型和人类胃癌患者样本,具有一定的跨模型和跨物种覆盖度,并同时包含蛋白质丰度与酰化修饰两个层面。然而,源站未提供样本量、数据完整性、缺失值比例、定量重复性、质控标准或批次效应等信息,因此无法对数据质量进行具体评价。此外,源站未说明人类样本的临床分期、治疗背景或恶病质诊断标准,也未说明小鼠模型的具体类型和造模方式,这些因素可能影响数据解释。使用者在分析时应关注物种差异、组织异质性以及酰化修饰数据的覆盖范围。源站未提供明确的局限性说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、文献出处、DOI、许可协议或使用条款。使用者如需引用或使用该数据集,应直接访问 omicsdi.org 上对应的数据集页面,查阅其附带的引用要求和许可信息。在未获得明确许可说明前,不应假定该数据集可自由用于商业或再分发用途。源站未提供相关授权细节。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/jpost/PXD035832
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们通过定量蛋白质组学和蛋白质酰化分析,分析了多种小鼠癌症恶病质模型和人类胃癌患者的样本。
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