phs000795:胃癌转移遗传分析

该数据集为 dbGaP 收录的胃癌遗传学研究,英文名 phs000795: Gastric Cancer Genetic Analysis of Metastasis,采用病例对照设计,聚焦胃癌转移相关的遗传分析

dbgap
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基因组分类Case-Control
phs000795: Gastric Cancer Genetic Analysis of Metastasis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000795:胃癌转移遗传分析

phs000795: Gastric Cancer Genetic Analysis of Metastasis 是收录于美国国家生物技术信息中心(NCBI)下属 dbGaP 数据库的一项胃癌遗传学研究数据集。该数据集以病例对照(Case-Control)设计为核心,聚焦于胃癌转移相关的遗传分析,旨在从遗传学角度探索胃癌转移的潜在机制。作为肿瘤领域中的胃癌专题数据资源,它为研究者提供了系统性的病例与对照样本遗传信息,有助于开展胃癌转移易感性、相关基因变异及分子机制的研究。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究项目,具有明确的病例对照研究属性,适用于遗传流行病学、肿瘤分子生物学及转化医学等多个方向的分析工作。

【数据集背景】

胃癌是全球范围内常见的恶性肿瘤之一,其转移过程是影响患者预后和生存率的关键因素。遗传因素在胃癌的发生、发展及转移中扮演重要角色,因此针对胃癌转移的遗传学分析具有重要的科研与临床价值。phs000795 数据集正是基于这一背景建立,采用病例对照研究设计,通过比较病例组与对照组之间的遗传差异,识别与胃癌转移相关的遗传变异。该数据集属于 dbGaP 收录的研究项目,dbGaP 作为 NCBI 的重要数据库,长期致力于存储和共享基因型与表型关联研究数据,为全球科研人员提供标准化的数据访问渠道。该数据集的英文全称为 Gastric Cancer Genetic Analysis of Metastasis,直接反映了其研究核心——胃癌转移的遗传分析。

【数据内容】

该数据集为 dbGaP 研究项目,采用病例对照设计。源站描述仅标明其为 dbGaP study (Case-Control),主题标签为 Case-Control。关于具体的样本数量、基因分型平台、测序深度、变异位点数量、临床变量字段等详细数据内容,源站未提供。因此,无法进一步说明该数据集所包含的具体遗传标记、样本分组规模或表型信息。用户如需了解数据文件的具体构成,应参考 dbGaP 项目页面中的数据集说明文档。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 数据库收录的研究。源站描述仅指出其为 dbGaP study (Case-Control),未提供样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息或具体的实验流程。关于样本来源人群、采集机构及数据生成方法等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其病例对照设计和胃癌转移遗传分析的主题,该数据集适用于以下研究方向:探索胃癌转移相关的遗传易感基因或变异位点;比较转移性胃癌病例与对照人群的等位基因频率差异;开展候选基因关联研究或全基因组关联分析的验证工作;进行胃癌转移分子机制的遗传学推断;以及作为 meta 分析或系统综述的组成部分。此外,该数据集也可用于遗传流行病学教学中病例对照设计的数据分析练习。但具体适用性需结合数据实际内容判断,源站未提供详细的数据使用案例。

【使用方法】

该数据集通过 dbGaP 平台提供访问。通常,dbGaP 数据的使用需要经过数据访问申请流程,获得授权后方可下载和分析。用户应遵循 dbGaP 的数据使用协议,根据研究目的选择相应的数据子集。分析时可采用病例对照关联分析、逻辑回归、生存分析等统计遗传学方法。由于源站未提供该数据集的具体文件格式、数据字典或分析指南,实际使用方法需参考 dbGaP 项目页面中的文档说明。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的病例对照研究,其质量依赖于原始研究的实验设计、样本收集和基因分型过程。源站未提供关于数据完整性、基因分型成功率、样本重复性、群体分层校正或缺失值处理等质量指标。限制方面,病例对照设计本身可能受到选择偏倚、回忆偏倚和混杂因素的影响;此外,源站未提供样本量、人群 ancestry 构成及转移表型定义等关键信息,因此无法评估其统计效能和外部推广性。用户在使用时应谨慎解读结果,并结合其他独立研究进行验证。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 数据库,英文名称为 phs000795: Gastric Cancer Genetic Analysis of Metastasis。关于具体的引用格式、许可条款、数据使用协议及访问权限要求,源站未提供。用户应直接访问 dbGaP 项目页面获取最新的引用指南和许可信息。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000795

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

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