胃癌分泌蛋白组挖掘：GRN作为早期胃癌潜在诊断标志物的鉴定

资源简介

胃癌分泌蛋白组挖掘：GRN作为早期胃癌潜在诊断标志物的鉴定

Mining the Gastric Cancer

Secretome: Identification

of GRN as a Potential Diagnostic Marker for Early Gastric Cancer

该数据集来自 figshare，配套 2012 年 Journal of Proteome Research 论文，围绕胃癌分泌蛋白组研究，采用 2D-LC-MS/MS 结合 iTRAQ 标记分析 AGS 与 MKN7 细胞系分泌蛋白组，并通过条件培养基与全细胞裂解物比较区分真正分泌蛋白与胞内污染物，鉴定出 90 个在条件培养基中丰度更高的蛋白，并预测其中多数可经经典或非经典途径输出。数据可用于胃癌早期诊断标志物筛选与分泌蛋白候选验证（来源 figshare，CC BY-NC 4.0 许可）。

【数据集背景】

配套论文《Mining the Gastric Cancer Secretome: Identification of GRN as a Potential Diagnostic Marker for Early Gastric Cancer》发表于 Journal of Proteome Research（2012），DOI：10.1021/pr201014h。源站首次发布：2012-03-02。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：胃癌是全球第二大癌症死亡原因，目前尚无临床相关的胃癌诊断或预后生物标志物。在本研究中，我们采用基于 2D-LC-MS/MS 的方法并结合 iTRAQ 标记，研究胃癌细胞系 AGS 和 MKN7 的分泌蛋白组。通过对条件培养基与全细胞裂解物进行比较分析，我们的流程使我们能够区分条件培养基中真正的分泌蛋白与胞内污染物。与 AGS 和 MKN7 细胞的全细胞裂解物相比，发现 90 个蛋白在条件培养基中丰度更高。使用信号肽和非经典分泌预测工具以及在线外泌体数据库，我们证明这 90 个蛋白中高达 92.2% 可通过经典

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 858.11 KB。数据集 DOI：10.1021/pr201014h.s003。

【主题与分类】

源站学科分类：Biophysics、Biochemistry、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics。主题标签：sandwich ELISA assay、Potential Diagnostic Marker、cell lysates、ROC、MKN 7 cells、nonclassical secretory pathways、cancer cell lines AGS、Gastric Cancer Secretome、protein、nonclassical secretion prediction tool。本站分类：肿瘤/胃癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics。

【获取与许可】

源站页面：https://acs.figshare.com/articles/dataset/Mining_the_Gastric_Cancer_Secretome_Identification_of_GRN_as_a_Potential_Diagnostic_Marker_for_Early_Gastric_Cancer/2545459

使用许可：CC BY-NC 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/）。

规范引用：Loei, Hendrick; Tan, Hwee Tong; Lim, Teck Kwang; Lim, Kiat Hon; So, Jimmy Bok-Yan; Yeoh, Khay Guan; et al. (2016). Mining the Gastric Cancer Secretome: Identification of GRN as a Potential Diagnostic Marker for Early Gastric Cancer. ACS Publications. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。