染色体5q和14q缺失标记预后良好的胃癌亚群
该数据集来自omicsdi.org,聚焦胃癌的DNA拷贝数变异与临床结局。研究对206例胃癌患者进行全基因组array comparative genomic hybridization分析,评估拷贝数谱与淋巴结状态及生存的相关性,并分析290例患者中HSP90蛋白表达与生存的关系,旨在基于拷贝数分

基本信息
资源简介
染色体5q和14q缺失标记预后良好的胃癌亚群
该数据集来自omicsdi.org,聚焦胃癌的DNA拷贝数变异与临床结局。研究对206例胃癌患者进行全基因组array comparative genomic hybridization分析,评估拷贝数谱与淋巴结状态及生存的相关性,并分析290例患者中HSP90蛋白表达与生存的关系,旨在基于拷贝数分型识别预后不同的患者亚组,为差异化治疗强度提供依据。数据可用于胃癌分子分型、预后标志物筛选及生存分析等研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:为改善胃癌患者的临床结局,重点多放在改进治疗方案上,包括更广泛的手术以及(新)辅助化疗。本研究旨在基于DNA拷贝数谱分析,识别具有不同临床结局、因而适合不同治疗强度的患者亚组。实验设计:分离206例胃癌患者的DNA,并通过全基因组array comparative genomic hybridization进行分析。评估DNA拷贝数谱,并将其与淋巴结状态和生存进行相关性分析。此外,分析290例胃癌患者中HSP90蛋白表达,并与生存进行相关性分析。结果:在染色体1p、6p、7p、7q、8q、11q、12q、13q、16p、16q、17q、19p、19q、20p、20q、21q和22q上观察到频繁(>20%)的DNA拷贝数增加,在染色体上观察到缺失
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/胃癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-26389
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- OpenDataLab:
数据说明
目的:为改善胃癌患者的临床结局,重点大多放在改进治疗方案上,包括更广泛的手术以及(新)辅助化疗。本研究旨在基于DNA拷贝数谱,识别具有不同临床结局、从而有资格接受不同治疗强度的患者亚组。实验设计:分离206例胃癌患者的DNA,并通过全基因组微阵列比较基因组杂交进行分析。评估DNA拷贝数谱,并将其与淋巴结状态和生存期进行相关性分析。此外,分析290例胃癌患者中HSP90蛋白表达,并将其与生存期进行相关性分析。结果:在染色体1p、6p、7p、7q、8q、11q、12q、13q、16p、16q、17q、19p、19q、20p、20q、21q和22q上观察到频繁(>20%)的DNA拷贝数增加,在染色体4p、4q、6p、6q、9p、13q和21q上观察到缺失。淋巴结阴性胃癌在染色体5q11.2-q35.1、10q11.23-21.3和14q32.11-q32.33上显示出显著更多的缺失。
此外,5q11.2-q31.3和14q32.11-q32.33的缺失与淋巴结阴性和阳性胃癌患者的良好临床结局高度相关。位于染色体14q32.2上的HSP90表达缺失与良好的生存时间相关。结论:全基因组DNA拷贝数分析有助于识别出一个胃癌亚组,该亚组以染色体5q11.2-q31.3和14q32.11-q32.33缺失为特征,单纯手术后临床结局极佳,且这些肿瘤患者不太可能从额外的强化治疗中获益。可能的生物学机制可能涉及热休克蛋白的缺失,其编码基因位于这些染色体区域。183例胃腺癌
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