PBRM1敲低AGS胃癌细胞奥沙利铂处理后的Bulk RNA-seq

该数据集为人类AGS胃癌细胞在PBRM1敲低(shPBRM1)与对照(shNC)条件下,分别经或未经奥沙利铂(5微摩尔,48小时)处理后的Bulk RNA-seq转录组数据

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基因组预测GPL342849606
GSE353436: Bulk RNA-seq of PBRM1-knockdown AGS gastric cancer cells treated with oxaliplatin

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

PBRM1敲低AGS胃癌细胞奥沙利铂处理后的Bulk RNA-seq

Bulk RNA-seq of PBRM1-knockdown AGS gastric cancer cells treated with oxaliplatin

该数据集为人类AGS胃癌细胞在PBRM1敲低(shPBRM1)与对照(shNC)条件下,分别经或未经奥沙利铂(5微摩尔,48小时)处理后的Bulk RNA-seq转录组数据。共四组(NC、SH、NCM、SHM),每组三个生物学重复,采用双端RNA测序,并提供基因水平read-count与FPKM矩阵。数据可用于分析PBRM1敲低及奥沙利铂暴露对胃癌细胞基因表达的影响,支持差异表达与通路层面的预测研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 04 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对转染shNC或shPBRM1并接受或未接受奥沙利铂处理的人AGS胃癌细胞进行Bulk转录组分析。四组分别为NC(shNC未处理奥沙利铂)、SH(shPBRM1未处理奥沙利铂)、NCM(shNC处理奥沙利铂)和SHM(shPBRM1处理奥沙利铂),每组生成三个生物学重复。奥沙利铂以5微摩尔处理48小时。进行双端RNA测序,并生成基因水平read-count和FPKM矩阵。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/胃癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE353436

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 05 202,引用时请注意版本时效。

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对人AGS胃癌细胞进行批量转录组分析,细胞分别转染shNC或shPBRM1,并分别在有或无奥沙利铂暴露条件下处理。四组每组各生成三个生物学重复:NC(shNC未加奥沙利铂)、SH(shPBRM1未加奥沙利铂)、NCM(shNC加奥沙利铂)和SHM(shPBRM1加奥沙利铂)。奥沙利铂以5微摩尔浓度处理48小时。进行双端RNA测序,并生成基因水平read计数和FPKM矩阵。

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