GPNMB敲低对HGC-27胃癌细胞转录组变化的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330529

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究表征了HGC-27胃癌细胞中与GPNMB敲低相关的转录组变化。细胞分别瞬时转染GPNMB靶向siRNA或非靶向对照siRNA。每组使用三个独立制备的生物学样本进行RNA测序。采用差异表达分析和富集分析来鉴定与GPNMB敲低相关的候选生物学过程和信号通路。包括cAMP信号通路在内的若干通路出现在名义富集结果中。因此，cAMP通路被作为后续实验研究的假设生成候选对象。所提交的转录组数据集本身并不能确立唯一的下游信号通路、免疫抑制功能、临床预后价值或治疗疗效。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。