人腹膜CCR2LowCRIgHigh巨噬细胞亚群呈现胚胎起源样表型

该数据集来自 NCBI GEO,包含胃癌患者腹水中 CCR2Low 与 CCR2High 巨噬细胞亚群的基因表达谱,采用高通量测序(GPL18573,人 9606)

geo
浏览 7
基因组分类GPL185739606
GSE308456: Human peritoneal CCR2LowCRIgHigh macrophage subset exhibits embryonic origin-like phenotypes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

人腹膜CCR2LowCRIgHigh巨噬细胞亚群呈现胚胎起源样表型

Human peritoneal CCR2LowCRIgHigh macrophage subset exhibits embryonic origin-like phenotypes

该数据集来自 NCBI GEO,包含胃癌患者腹水中 CCR2Low 与 CCR2High 巨噬细胞亚群的基因表达谱,采用高通量测序(GPL18573,人 9606)。研究关注 CCR2LowCRIgHigh 亚群呈现胚胎起源样表型,并表达细胞增殖标志物。数据可用于比较不同供者间亚群比例差异、分析亚群基因表达特征,以及探索巨噬细胞起源相关表型在人类组织中的表现(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 18 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):由骨髓来源单核细胞的分化以及源自卵黄囊或胎肝的巨噬细胞的增殖所维持。然而,这种范式转变在人类组织中的程度尚不完全清楚。在这里,我们检测到一个呈现胚胎起源样表型的人腹膜巨噬细胞亚群。胃癌患者腹水中的巨噬细胞被分为 CCR2Low 和 CCR2High 亚群,其比例在不同供者间存在差异。这些亚群的基因表达谱与心脏中的巨噬细胞亚群相似。CRIg 最近被报道可作为区分肝硬化患者腹水中两种巨噬细胞亚群的标志物。本研究中鉴定的 CCR2Low 和 CCR2High 亚群分别高水平和高水平表达 CRIg。重要的是,CCR2LowCRIgHigh 亚群表达细胞增殖标志物

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/胃癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308456

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 23 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308456

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这一观点主要基于骨髓来源单核细胞的分化以及源自卵黄囊或胎肝的巨噬细胞增殖。然而,这种范式转变在人体组织中的适用程度尚不完全清楚。在此,我们检测到一种具有胚胎起源样表型的人腹膜巨噬细胞亚群。胃癌患者腹水中的巨噬细胞分为CCR2低表达和CCR2高表达两个亚群,其比例在供体间存在差异。这些亚群的基因表达谱与心脏中的巨噬细胞亚群相似。CRIg近期被报道可作为区分肝硬化患者腹水中两种巨噬细胞亚群的标志物。本研究中鉴定的CCR2低表达和CCR2高表达亚群分别高水平和低水平表达CRIg。重要的是,CCR2低表达CRIg高表达亚群表达细胞增殖标志物Ki67以及近期提出的胚胎起源巨噬细胞核心标志物(TIMD4、LYVE1和FOLR2)的水平高于CCR2高表达CRIg低表达亚群。

此外,心脏、肺、肾脏和肝脏中TIMD4+LYVE1+FOLR2+巨噬细胞共享的许多其他标志物,在腹腔CCR2LowCRIgHigh亚群中也表现出相似的表达模式。这些结果表明,腹腔中的CCR2LowCRIgHigh亚群包含具有胚胎起源的巨噬细胞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案