GSE284638：肌动蛋白失调通过氧化应激激活的PD-L1诱导胃癌免疫逃逸

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE284638

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数据说明

CRACD基因（也称为KIAA1211或CRAD）编码一种加帽蛋白调节因子，通过结合并抑制加帽蛋白来促进肌动蛋白聚合。由于基因突变或表达水平降低，CRACD在肿瘤细胞中经常失活。此外，CRACD功能缺失在胃肿瘤细胞中常见。为了阐明CRACD缺失对胃肿瘤发生的影响，我们对以下样本进行了单细胞RNA测序：(A) 基因工程小鼠胃类器官（野生型 versus Cracd敲除[KO] versus KrasG12D Trp53 KO [KP] versus Cracd KO KrasG12D Trp53 KO [CKP]），(B) 将KP或CKP细胞皮下注射到免疫健全C57BL/6小鼠后获得的鼠肿瘤，以及© 将KP或CKP细胞原位注射到免疫健全C57BL/6小鼠胃中获得的鼠肿瘤。值得注意的是，基因工程类器官和细胞均来源于C57BL/6小鼠。在本研究中，我们发现CRACD缺失驱动异常细胞可塑性和免疫景观重塑。

在机制上，CRACD缺失导致肌动蛋白失调，进而升高细胞内活性氧水平，随后激活HIF1α介导的PD-L1（一种免疫检查点抑制剂）反式激活，从而促进T细胞耗竭。本研究揭示了CRACD在胃肿瘤发生中作为抑癌基因的意外作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。