胃癌组织与血清标志物表达谱数据集
GSE27342 包含80对胃癌及参考组织的转录组数据，用于胃癌标志物、差异表达和分子诊断研究。由Gene Expression Omnibus提供，来自Gene Expression Omnibus，数据格式为表格，包含160条数据记录，适用于分类任务。
基本信息
资源简介
胃癌组织与血清标志物表达谱数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Transcriptome analysis on gastric cancer》。源站首次发布：Feb 16 201。
【数据内容】
源站原始描述：Reliable identification of cancer markers can have substantial implications to early detection of cancer. We report here an integrated computational and experimental study on identification of gastric cancer markers in patients’ tissue and sera based on (i) genome-scale transcriptomic analyses on 80 paired gastric cancer/reference tissues, with the aim of identifying abnormally expressed genes at various subtypes/stages of gastric carcinoma (ii) a computational identification of differentially e…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL5175、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27342
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 18 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27342
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE27342 包含80对胃癌及参考组织的转录组数据，用于胃癌标志物、差异表达和分子诊断研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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