胃癌腹膜转移转移途径特异性信号及微环境相互作用数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237876

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胃癌（GC）是全球癌症相关死亡的重要原因，其转移模式包括血行转移、腹膜转移和卵巢转移。尽管GC的基因表达模式已被广泛研究，但转移特异性基因表达图谱在很大程度上仍未被探索。本研究对来自14例患者的66对原发性和转移性（血行、腹膜或卵巢）GC肿瘤进行了全转录组测序分析，鉴定出122个独特的转移特异性上皮-间质转化（msEMT）基因。这些基因根据转移途径表现出不同的表达模式，提示GC转移中存在途径特异性分子机制。在原发肿瘤中，msEMT基因的高表达与CDH1突变更频繁、基因组稳定亚型以及癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）GC队列中的不良预后相关。这一关联在两个独立队列（GSE66229；n=300，GSE84437；n=433）中得到了进一步证实，表现为不良预后以及对腹膜或卵巢复发的高预测性能。

对原发肿瘤（GSE167297）和四份来自胃癌患者的独立腹水样本进行的单细胞RNA测序分析显示，msEMT基因主要在不同的成纤维细胞亚群中表达，而非癌细胞。本研究阐明了路线特异性机制，并强调了msEMT基因和癌症相关成纤维细胞在胃癌转移中的重要性，为未来研究指明了潜在方向。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。