新建立的49株胃癌细胞系mRNA表达谱
该数据集收录了新建立的49株胃癌细胞系的mRNA表达谱，样本来源于18例患者的腹水，为腹膜转移性胃癌细胞系。数据采用表达谱芯片检测，平台为GPL570，物种为人（9606）
基本信息
资源简介
新建立的49株胃癌细胞系mRNA表达谱
GSE172197 是一个面向胃癌研究的基因表达谱数据集，收录了新建立的 49 株胃癌细胞系的 mRNA 表达数据。这些细胞系来源于 18 例患者的腹水，属于腹膜转移性胃癌细胞系，因而该数据集在细胞系建立与分子特征刻画层面具有明确的临床来源背景。数据通过表达谱芯片检测获得，所用平台为 GPL570，物种为人（9606）。数据集整体以单个文件形式提供，适合从事胃癌细胞系转录组特征分析、腹膜转移相关研究以及表达谱数据整合利用的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集对应的源站标题为“mRNA expression profiles of newly established 49 gastric cancer cell lines”，即新建立的 49 株胃癌细胞系的 mRNA 表达谱。源站进一步说明，这些细胞系是从 18 例患者的腹水中建立并完成分子特征刻画的腹膜转移性胃癌细胞系。胃癌腹膜转移是临床研究关注的重要方向，而可稳定培养并具备分子注释的细胞系资源对于相关机制研究和体外模型构建具有基础性价值。该数据集正是围绕这一细胞系资源产生的表达谱数据集合。
【数据内容】
数据集的内容为 49 株胃癌细胞系的 mRNA 表达谱，检测对象为人源样本。数据以表达谱芯片方式产生，主题标签中标注了“Expression profiling by array”、平台 GPL570 以及物种编号 9606。数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE172197_series_matrix.txt.gz，即系列矩阵文件，通常用于承载各样本的表达值矩阵及样本层面的注释信息。本站将其归类为肿瘤 / 胃癌方向。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Fumiko，Chiwaki，发布时间标注为 Apr 16 202。样本的生物学来源为 18 例患者的腹水，由此建立 49 株腹膜转移性胃癌细胞系，并对其进行 mRNA 表达谱检测。除上述来源信息外，源站未提供更详细的采集流程、伦理审批或临床资料说明。
【适用场景】
该数据集可用于胃癌细胞系表达谱层面的比较与特征描述，支持围绕腹膜转移性胃癌细胞系的转录组特征开展分析；也可作为表达谱芯片数据（GPL570 平台、人源样本）纳入更大规模的数据整合研究。对于需要利用新建立胃癌细胞系模型开展体外研究的研究者，该数据可作为细胞系分子背景的参考信息。具体分析目的与适用范围应结合研究者自身设计确定。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE172197_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩格式，需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式，确认无误后再进行批量接入，以避免因文件解析问题导致的数据错误。源站未提供额外的预处理步骤或分析流程说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，样本量对应 49 株细胞系，来源于 18 例患者腹水。源站未提供质控指标、批次信息、重复样本情况或数据完整性说明，相关质量评估需使用者自行开展。此外，源站未提供细胞系的临床背景、用药史或随访信息，限制了基于临床变量的分层分析。
【引用与许可】
作者为 Fumiko，Chiwaki，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的许可条款与引用规范说明，使用与再分发前应向数据来源方核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE172197
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从18例患者腹水中建立49株腹膜转移性胃癌细胞系及其分子特征分析。我们利用微阵列对本研究建立的胃癌细胞系进行了全面的转录组分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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