胃癌亚型分型（新加坡患者队列，batch B）
胃癌在患者间存在显著异质性，基于基因表达谱可发现具有特定生物学特性或治疗脆弱性的亚型，为理解癌症进展机制和个体化治疗提供基础
基本信息
资源简介
胃癌亚型分型（新加坡患者队列，batch B）
该数据集来自 omicsdi.org，为新加坡患者队列 batch B 的 56 例原发性胃肿瘤全基因组 mRNA 表达谱，使用 Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array 检测。胃癌在患者间存在显著异质性，基于基因表达谱可发现具有特定生物学特性或治疗脆弱性的亚型，为理解癌症进展机制和个体化治疗提供基础。该数据可用于胃癌分子亚型聚类与分类研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：来自新加坡患者队列 batch B 的 56 例原发性胃肿瘤的全基因组 mRNA 表达谱。与许多癌症一样，胃腺癌（胃癌）在患者之间表现出相当大的异质性。因此，人们强烈希望利用基因表达谱来发现具有特定生物学特性或治疗脆弱性的胃癌亚型。识别此类亚型可为癌症进展机制提供见解，或为个体化治疗奠定基础。在此，我们报告了对来自新加坡患者的大量胃腺癌集合（连同 GSE15459）进行的稳健的基于基因表达的聚类。使用 Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array 对 56 例原发性胃肿瘤进行了分析。所有肿瘤均在获得新加坡国家癌症中心批准的情况下收集；研究伦理审查
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/胃癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-34942
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-34942
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
来自新加坡患者队列（批次B）的56例原发性胃肿瘤的全基因组mRNA表达谱。与许多癌症一样，胃腺癌（胃癌）在患者之间表现出相当大的异质性。因此，利用基因表达谱来发现具有特定生物学特性或治疗脆弱性的胃癌亚型引起了强烈兴趣。识别此类亚型可为癌症进展机制提供见解，或为个性化治疗奠定基础。在此，我们报告了来自新加坡患者的大量胃腺癌集合（GSE15459）基于基因表达的稳健聚类分析。使用Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array对56例原发性胃肿瘤进行了表达谱分析。所有肿瘤均在获得新加坡国家癌症中心、研究伦理审查委员会批准以及患者签署知情同意书后采集。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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