胃癌亚型(澳大利亚患者队列)
70例澳大利亚胃癌患者的全基因组mRNA表达谱,用于胃癌分子亚型分类研究。

基本信息
资源简介
胃癌亚型(澳大利亚患者队列)
【一句话概览】
该数据集题为胃腺癌分型(澳大利亚患者队列),提供来自澳大利亚患者队列的70例原发胃肿瘤全基因组mRNA表达谱。胃腺癌如同许多癌症一样,在患者间表现出显著异质性,因此人们关注利用基因表达谱发现具有特定生物学特性或治疗易感性的胃癌亚型。数据含1个文件,标签显示为芯片表达谱检测,平台为GPL570,物种为9606(来源 NCBI)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gastric Cancer Subtyping (Australian Patient Cohort)》。源站首次发布:Feb 14 201。
【数据内容】
源站原始描述:Genome-wide mRNA expression profiles of 70 primary gastric tumors from the Australian patient cohort. Like many cancers, gastric adenocarcinomas (gastric cancers) show considerable heterogeneity between patients. Thus, there is intense interest in using gene expression profiles to discover subtypes of gastric cancers with particular biological properties or therapeutic vulnerabilities
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):来自澳大利亚患者队列的70例原发性胃肿瘤的全基因组mRNA表达谱。与许多癌症一样,胃腺癌(胃癌)在患者之间表现出相当大的异质性。因此,人们对于利用基因表达谱来发现具有特定生物学特性或治疗脆弱性的胃癌亚型有着浓厚的兴趣。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35809
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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