拉丁美洲胃癌高危人群内镜监测：ECHOS队列研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05969444

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：胃癌、胃异型增生、萎缩性胃炎、幽门螺杆菌感染。内镜队列与组织学OLGA分期（ECHOS）研究是一项回顾性纵向队列研究，建立于智利天主教大学医疗保健系统内，该系统为开放式医疗保健系统，在智利圣地亚哥设有3个内镜中心。年龄18岁及以上的患者，若在2015年6月至2021年6月期间至少接受过一次非急诊门诊EGD，且按照USSBP采集了胃活检，则符合研究入选条件。基线EGD定义为该时间段内符合入选标准的最早一次检查。参与者在接受后续“监测”EGD后纳入队列。为使后续EGD符合监测要求，该检查须在基线EGD后至少6个月进行，并包括按照USSBP采集的胃活检；USSBP要求的一项例外情况是，在监测（即非基线）EGD中检测到HGD或GA。有HGD病史或任何类型胃恶性肿瘤病史、胃切除术史或非胃活动性恶性肿瘤的患者被排除在外。

此外，基线EGD检查显示高度异型增生（HGD）或胃萎缩（GA）的患者被排除在外。基线EGD检查结果为不确定（IND）或低度异型增生（LGD）的患者则被考虑纳入队列。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。