幽门螺杆菌微阵列开发用于检测临床分离株致病性
本数据集来自 omicsdi.org，主题为肿瘤/胃癌，属于转录组学数据。研究利用全基因组表达谱作为平台，分析幽门螺杆菌临床分离株感染胃上皮细胞后的宿主-病原互作，以区分可能导致更严重疾病的菌株
基本信息
资源简介
幽门螺杆菌微阵列开发用于检测临床分离株致病性
本数据集来自 omicsdi.org，主题为肿瘤/胃癌，属于转录组学数据。研究利用全基因组表达谱作为平台，分析幽门螺杆菌临床分离株感染胃上皮细胞后的宿主-病原互作，以区分可能导致更严重疾病的菌株。数据覆盖来自哥伦比亚胃癌高发区的3株临床分离株（PZ5056、PZ5080、PZ5086）和低发区的3株分离株（PZ5004、PZ5024、PZ5026），每个实验以感染胃上皮细胞单层1小时的方式重复三次。该数据可用于识别与高癌症风险菌株相关的基因特征，辅助胃癌风险相关分类研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了区分可能在患者中引起更严重疾病的幽门螺杆菌分离株，我们使用全基因组表达谱作为平台来研究宿主-病原互作，并识别与来自较高癌症风险患者的分离株相关的基因特征。我们研究了来自哥伦比亚胃癌高发区的3株临床分离株（PZ5056、PZ5080、PZ5086）和来自哥伦比亚胃癌低发区的3株分离株（PZ5004、PZ5024、PZ5026）的表达谱。每个实验通过用分离株感染胃上皮细胞单层1小时，并重复三次进行。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/胃癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-41497
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-41497
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了区分可能导致患者病情更严重的幽门螺杆菌分离株，我们采用全基因组表达谱分析作为平台，研究宿主-病原体相互作用，并识别与来自癌症风险较高患者的分离株相关的基因特征。我们研究了来自哥伦比亚胃癌高发地区的3株临床分离株（PZ5056、PZ5080、PZ5086）和来自哥伦比亚胃癌低发地区的3株分离株（PZ5004、PZ5024、PZ5026）的表达谱。每项实验均以这些分离株感染胃上皮细胞单层1小时，并做三次重复。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
